36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0534 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0534  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  710    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  53.54 
 
 		 342 aa  342  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0252538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2328  hypothetical protein  53.67 
 
 		 256 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4234  Protein of unknown function DUF1626  37.46 
 
 		 274 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4195  Protein of unknown function DUF1626  37.46 
 
 		 274 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2960  Protein of unknown function DUF1626  65.71 
 
 		 233 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635149 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  30.48 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  31.36 
 
 		 242 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1548  hypothetical protein  34.04 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  29.41 
 
 		 284 aa  107  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1303  hypothetical protein  28.74 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0531274 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  39.5 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1920  hypothetical protein  35.29 
 
 		 217 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1627  hypothetical protein  39.81 
 
 		 294 aa  96.3  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00194583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0437  hypothetical protein  36.36 
 
 		 247 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0452  hypothetical protein  33.09 
 
 		 219 aa  89.4  9e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1477  hypothetical protein  34.38 
 
 		 224 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.206877  normal  0.225419 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0991  hypothetical protein  33.73 
 
 		 241 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.95618  normal  0.04449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1977  hypothetical protein  30.11 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.529646  hitchhiker  0.0000143313 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1976  hypothetical protein  29.53 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000586901 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1170  hypothetical protein  30.95 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0259926 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1071  hypothetical protein  34.11 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  normal  0.0673929 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1072  hypothetical protein  30.37 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.304238  normal  0.0380408 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0737  Protein of unknown function DUF1626  31.25 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000438836  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4139  hypothetical protein  58.73 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1429  hypothetical protein  29.82 
 
 		 124 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.220825  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0222  hypothetical protein  32.5 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1148  hypothetical protein  31.96 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0283624 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1705  hypothetical protein  24.36 
 
 		 271 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.594083  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  25.71 
 
 		 194 aa  50.1  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  25.58 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  28.74 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  31.97 
 
 		 317 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  28.65 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1367 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  22.11 
 
 		 1143 aa  43.1  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>