48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2328 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2328  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  69.45 
 
 		 342 aa  411  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0252538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0534  hypothetical protein  53.99 
 
 		 357 aa  298  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4234  Protein of unknown function DUF1626  49.81 
 
 		 274 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4195  Protein of unknown function DUF1626  49.81 
 
 		 274 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2960  Protein of unknown function DUF1626  45.08 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635149 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  36.8 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  35.62 
 
 		 336 aa  135  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1303  hypothetical protein  32.8 
 
 		 297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0531274 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1548  hypothetical protein  37.22 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  31.22 
 
 		 270 aa  122  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1920  hypothetical protein  37.91 
 
 		 217 aa  106  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1170  hypothetical protein  37.91 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0259926 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0437  hypothetical protein  32.95 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1627  hypothetical protein  37.04 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00194583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  26.96 
 
 		 284 aa  88.6  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1976  hypothetical protein  33.1 
 
 		 339 aa  85.9  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000586901 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1072  hypothetical protein  33.09 
 
 		 323 aa  85.5  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.304238  normal  0.0380408 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0452  hypothetical protein  32.35 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1477  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.206877  normal  0.225419 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1071  hypothetical protein  32.03 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  normal  0.0673929 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1977  hypothetical protein  30.72 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.529646  hitchhiker  0.0000143313 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0737  Protein of unknown function DUF1626  30.15 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000438836  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0991  hypothetical protein  30.4 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.95618  normal  0.04449 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1705  hypothetical protein  26.14 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.594083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  49.38 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1429  hypothetical protein  28.07 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.220825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  49.38 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  44.66 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  38.14 
 
 		 305 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  45.63 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  43.3 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  47.13 
 
 		 333 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0222  hypothetical protein  26.41 
 
 		 327 aa  49.7  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  47.13 
 
 		 333 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2214  Protein of unknown function DUF1626  24.07 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.346071  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0492  hypothetical protein  39.39 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.821112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  39.62 
 
 		 334 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  26.18 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4139  hypothetical protein  66.67 
 
 		 68 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1408  paREP7  33.82 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165903  normal  0.389588 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1148  hypothetical protein  26.14 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0283624 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0327  paREP7  31.82 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0185  paREP7  30 
 
 		 253 aa  45.8  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  0.966821 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  24.21 
 
 		 380 aa  45.8  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  29.56 
 
 		 353 aa  42.4  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  24.32 
 
 		 328 aa  42.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  45.95 
 
 		 287 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>