35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1408 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1408  paREP7  100 
 
 
229 aa  440  1e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165903  normal  0.389588 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1276  hypothetical protein  60.17 
 
 
244 aa  275  3e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.160585 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2036  hypothetical protein  59.75 
 
 
244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1695  paREP7  55 
 
 
226 aa  249  2e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1150  hypothetical protein  54.72 
 
 
254 aa  218  6e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal  0.0462883 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  57.02 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1156  hypothetical protein  80 
 
 
149 aa  126  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874772 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0185  paREP7  40.17 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  0.966821 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0327  paREP7  40.87 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0492  hypothetical protein  67.12 
 
 
229 aa  101  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.821112 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1920  hypothetical protein  36.71 
 
 
217 aa  88.2  9e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1170  hypothetical protein  36.71 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0259926 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1343  chromosome segregation ATPases-like  38.71 
 
 
321 aa  68.6  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1548  hypothetical protein  31.51 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  37.82 
 
 
270 aa  62.4  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  40.16 
 
 
305 aa  62.4  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  36.05 
 
 
380 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  35.19 
 
 
284 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1685  hypothetical protein  30.66 
 
 
386 aa  55.1  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000183285  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1303  hypothetical protein  35.29 
 
 
297 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0531274 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0460  hypothetical protein  29.13 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  41.27 
 
 
342 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0252538 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1375  hypothetical protein  29.91 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1642  paREP7  36.78 
 
 
85 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.994633 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2214  Protein of unknown function DUF1626  27.66 
 
 
324 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.346071  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4195  Protein of unknown function DUF1626  20.91 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4234  Protein of unknown function DUF1626  20.91 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2328  hypothetical protein  33.82 
 
 
256 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0067  hypothetical protein  62.16 
 
 
91 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.125226  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0971  hypothetical protein  38.36 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.801412  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  26.76 
 
 
385 aa  45.1  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  25.46 
 
 
328 aa  45.4  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  27.72 
 
 
317 aa  43.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0911  hypothetical protein  24.66 
 
 
263 aa  42.7  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0149875  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1907  paREP7  26.62 
 
 
303 aa  42.4  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000000796589  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>