48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1548 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1548  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  429  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1303  hypothetical protein  73.4 
 
 
297 aa  259  2e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0531274 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  57.84 
 
 
270 aa  259  2e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  46.09 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1920  hypothetical protein  43.67 
 
 
217 aa  152  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  40.49 
 
 
336 aa  151  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1170  hypothetical protein  44.05 
 
 
222 aa  149  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0259926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  38.8 
 
 
342 aa  129  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0252538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2328  hypothetical protein  37.22 
 
 
256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1627  hypothetical protein  45.52 
 
 
294 aa  120  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00194583  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1976  hypothetical protein  41.1 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000586901 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0437  hypothetical protein  50.4 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4234  Protein of unknown function DUF1626  32.71 
 
 
274 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4195  Protein of unknown function DUF1626  32.71 
 
 
274 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1977  hypothetical protein  42.35 
 
 
368 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.529646  hitchhiker  0.0000143313 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1071  hypothetical protein  43.71 
 
 
317 aa  116  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  normal  0.0673929 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1072  hypothetical protein  39.73 
 
 
323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.304238  normal  0.0380408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2960  Protein of unknown function DUF1626  31.82 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0534  hypothetical protein  34.04 
 
 
357 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0452  hypothetical protein  37.35 
 
 
219 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  33.33 
 
 
284 aa  101  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0991  hypothetical protein  33 
 
 
241 aa  100  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.95618  normal  0.04449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0737  Protein of unknown function DUF1626  32.55 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000438836  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1477  hypothetical protein  38.67 
 
 
224 aa  96.7  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.206877  normal  0.225419 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0460  hypothetical protein  47.87 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1429  hypothetical protein  44.74 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.220825  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  27.34 
 
 
305 aa  71.6  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1695  paREP7  31.58 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1516  hypothetical protein  31.02 
 
 
195 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000303236 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1705  hypothetical protein  26.46 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.594083  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1685  hypothetical protein  40.4 
 
 
386 aa  61.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000183285  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  29.57 
 
 
317 aa  60.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1276  hypothetical protein  28.28 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.160585 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2036  hypothetical protein  28.57 
 
 
244 aa  55.8  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1148  hypothetical protein  26.32 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0283624 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  29.66 
 
 
380 aa  52.8  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1156  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874772 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0067  hypothetical protein  40.54 
 
 
91 aa  51.6  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.125226  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1408  paREP7  29.46 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165903  normal  0.389588 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  28.95 
 
 
385 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0185  paREP7  41.56 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  0.966821 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0327  paREP7  41.56 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1375  hypothetical protein  26.64 
 
 
239 aa  48.5  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1150  hypothetical protein  41.03 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal  0.0462883 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0222  hypothetical protein  29.82 
 
 
327 aa  45.8  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2214  Protein of unknown function DUF1626  27.55 
 
 
324 aa  45.8  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.346071  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0971  hypothetical protein  29.56 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.801412  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1343  chromosome segregation ATPases-like  31.76 
 
 
321 aa  42.4  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>