58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1768 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  757    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  40.52 
 
 
380 aa  240  4e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2214  Protein of unknown function DUF1626  36.97 
 
 
324 aa  224  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.346071  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1705  hypothetical protein  30.37 
 
 
271 aa  120  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.594083  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1148  hypothetical protein  38.1 
 
 
220 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0283624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0557  hypothetical protein  34.11 
 
 
356 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1516  hypothetical protein  33.58 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000303236 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1343  chromosome segregation ATPases-like  30.23 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  28.65 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  28.28 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  24.7 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4157  hypothetical protein  38.13 
 
 
201 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0018779  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0621  hypothetical protein  33.73 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149956  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1303  hypothetical protein  25.36 
 
 
297 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0531274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  23.21 
 
 
342 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0252538 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2563  conserved hypothetical protein  22.19 
 
 
323 aa  61.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  24.16 
 
 
869 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  24.16 
 
 
869 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  24.16 
 
 
869 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  23.6 
 
 
869 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  21.31 
 
 
1037 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  26.16 
 
 
284 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  21.89 
 
 
911 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1548  hypothetical protein  28.95 
 
 
219 aa  56.6  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  26.73 
 
 
242 aa  56.2  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0452  hypothetical protein  29.63 
 
 
219 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  22.54 
 
 
825 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  30.61 
 
 
270 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3381  hypothetical protein  26.36 
 
 
233 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1071  hypothetical protein  26.39 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  normal  0.0673929 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  19.66 
 
 
915 aa  50.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  21.91 
 
 
769 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2314  conserved hypothetical protein  22.91 
 
 
288 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.856278  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  26.49 
 
 
985 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0549  hypothetical protein  18.72 
 
 
767 aa  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1177  coiled-coil protein  29.46 
 
 
243 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1977  hypothetical protein  25.69 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.529646  hitchhiker  0.0000143313 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0387  hypothetical protein  39.13 
 
 
251 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4234  Protein of unknown function DUF1626  24.29 
 
 
274 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4195  Protein of unknown function DUF1626  24.29 
 
 
274 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1920  hypothetical protein  33.68 
 
 
217 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  28.57 
 
 
1092 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  22 
 
 
649 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1170  hypothetical protein  33.68 
 
 
222 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0259926 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1072  hypothetical protein  27.17 
 
 
323 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.304238  normal  0.0380408 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1976  hypothetical protein  30.49 
 
 
339 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000586901 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  28.95 
 
 
1232 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0222  hypothetical protein  27.57 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2328  hypothetical protein  21.43 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  27.84 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1685  hypothetical protein  28.76 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000183285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  20.1 
 
 
666 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  21.58 
 
 
782 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1477  hypothetical protein  26.73 
 
 
224 aa  43.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.206877  normal  0.225419 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  22.77 
 
 
1040 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  22.86 
 
 
988 aa  43.1  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0534  hypothetical protein  24.51 
 
 
357 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1375  hypothetical protein  32.61 
 
 
239 aa  42.7  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>