30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0452 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0452  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  430  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0737  Protein of unknown function DUF1626  51.79 
 
 
252 aa  270  1e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000438836  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1477  hypothetical protein  58.11 
 
 
224 aa  264  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.206877  normal  0.225419 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1071  hypothetical protein  44.23 
 
 
317 aa  237  1e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  normal  0.0673929 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0437  hypothetical protein  52.07 
 
 
247 aa  230  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1977  hypothetical protein  64.12 
 
 
368 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.529646  hitchhiker  0.0000143313 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1627  hypothetical protein  57.65 
 
 
294 aa  188  5e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00194583  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1072  hypothetical protein  53.11 
 
 
323 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.304238  normal  0.0380408 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1976  hypothetical protein  47.67 
 
 
339 aa  172  5e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000586901 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1303  hypothetical protein  37.5 
 
 
297 aa  105  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0531274 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1548  hypothetical protein  37.35 
 
 
219 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  39.74 
 
 
270 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  39.18 
 
 
242 aa  99  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2960  Protein of unknown function DUF1626  36.03 
 
 
233 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635149 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  36.55 
 
 
284 aa  92.4  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0991  hypothetical protein  33.53 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.95618  normal  0.04449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4234  Protein of unknown function DUF1626  34.56 
 
 
274 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4195  Protein of unknown function DUF1626  34.56 
 
 
274 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0534  hypothetical protein  33.87 
 
 
357 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  33.15 
 
 
342 aa  85.5  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0252538 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  41.1 
 
 
336 aa  85.5  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2328  hypothetical protein  32.35 
 
 
256 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1920  hypothetical protein  41.96 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1170  hypothetical protein  40.79 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0259926 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1429  hypothetical protein  44.68 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.220825  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  28.72 
 
 
380 aa  55.8  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2214  Protein of unknown function DUF1626  27.13 
 
 
324 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.346071  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1148  hypothetical protein  27.95 
 
 
220 aa  48.9  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0283624 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  28.15 
 
 
385 aa  46.6  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0038  hypothetical protein  39.09 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>