21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0038 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0038  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  526  1e-148  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0093  hypothetical protein  71.06 
 
 
311 aa  383  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000428603 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0971  hypothetical protein  53.45 
 
 
206 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.801412  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  46.09 
 
 
353 aa  122  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0222  hypothetical protein  39.13 
 
 
327 aa  108  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0460  hypothetical protein  42.54 
 
 
212 aa  106  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1071  hypothetical protein  46.27 
 
 
317 aa  96.3  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  normal  0.0673929 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1627  hypothetical protein  45.89 
 
 
294 aa  89.4  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00194583  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1977  hypothetical protein  41.61 
 
 
368 aa  86.3  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.529646  hitchhiker  0.0000143313 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1072  hypothetical protein  41.18 
 
 
323 aa  85.5  8e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.304238  normal  0.0380408 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1976  hypothetical protein  53.61 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000586901 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  32.03 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0737  Protein of unknown function DUF1626  39.02 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000438836  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1477  hypothetical protein  50.65 
 
 
224 aa  63.2  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.206877  normal  0.225419 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0437  hypothetical protein  40.87 
 
 
247 aa  59.3  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2389  hypothetical protein  40 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4448  hypothetical protein  49.09 
 
 
109 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1557  hypothetical protein  37.89 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0452  hypothetical protein  39.09 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1343  chromosome segregation ATPases-like  28.73 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0952  hypothetical protein  22.69 
 
 
177 aa  42.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0012758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>