65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1852 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  100 
 
 
380 aa  727    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2214  Protein of unknown function DUF1626  43.17 
 
 
324 aa  231  2e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.346071  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  40.52 
 
 
385 aa  218  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0557  hypothetical protein  40.76 
 
 
356 aa  133  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1343  chromosome segregation ATPases-like  35.2 
 
 
321 aa  132  9e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1705  hypothetical protein  33.21 
 
 
271 aa  98.6  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.594083  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  27.11 
 
 
353 aa  82  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  20.18 
 
 
1114 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1148  hypothetical protein  29.5 
 
 
220 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0283624 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2563  conserved hypothetical protein  28.17 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1516  hypothetical protein  33.08 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000303236 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  29.05 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  35.23 
 
 
270 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0621  hypothetical protein  32.54 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149956  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0387  hypothetical protein  40.19 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  21.94 
 
 
1111 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  32.68 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  28.26 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1303  hypothetical protein  29.8 
 
 
297 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0531274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  25.26 
 
 
342 aa  63.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0252538 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1685  hypothetical protein  30.23 
 
 
386 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000183285  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  29.78 
 
 
284 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  21.15 
 
 
911 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1920  hypothetical protein  31.72 
 
 
217 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0737  Protein of unknown function DUF1626  29.03 
 
 
252 aa  57.4  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000438836  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0991  hypothetical protein  28.36 
 
 
241 aa  57  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.95618  normal  0.04449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1977  hypothetical protein  27.71 
 
 
368 aa  56.6  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.529646  hitchhiker  0.0000143313 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1071  hypothetical protein  28.31 
 
 
317 aa  56.2  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  normal  0.0673929 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05595  involucrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G11410)  23.76 
 
 
941 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1170  hypothetical protein  30.34 
 
 
222 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0259926 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0452  hypothetical protein  28.72 
 
 
219 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  19.91 
 
 
915 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2314  conserved hypothetical protein  24.49 
 
 
288 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.856278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4234  Protein of unknown function DUF1626  22.42 
 
 
274 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4195  Protein of unknown function DUF1626  22.42 
 
 
274 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  21.29 
 
 
869 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1548  hypothetical protein  29.66 
 
 
219 aa  52.8  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  22.4 
 
 
869 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0437  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1477  hypothetical protein  28.08 
 
 
224 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.206877  normal  0.225419 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  22.4 
 
 
869 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2960  Protein of unknown function DUF1626  29.41 
 
 
233 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635149 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1627  hypothetical protein  31.68 
 
 
294 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00194583  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4157  hypothetical protein  33.99 
 
 
201 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0018779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  21.31 
 
 
666 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  30.2 
 
 
1364 aa  49.7  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1976  hypothetical protein  35.06 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000586901 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1072  hypothetical protein  33.77 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.304238  normal  0.0380408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0534  hypothetical protein  30.34 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  25.66 
 
 
1682 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2227  hypothetical protein  36.3 
 
 
241 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  29.7 
 
 
305 aa  47.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  22.63 
 
 
1049 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  22.01 
 
 
797 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  23.22 
 
 
869 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2328  hypothetical protein  24.21 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0521  hypothetical protein  33.06 
 
 
179 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  20.81 
 
 
769 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1071  hypothetical protein  20.45 
 
 
657 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1375  hypothetical protein  46.77 
 
 
239 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
825 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  24.21 
 
 
2196 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3500  hypothetical protein  27.34 
 
 
199 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  21.74 
 
 
816 aa  43.5  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  15.97 
 
 
2228 aa  43.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>