29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2960 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2960  Protein of unknown function DUF1626  100 
 
 
233 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4234  Protein of unknown function DUF1626  48.53 
 
 
274 aa  261  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4195  Protein of unknown function DUF1626  48.53 
 
 
274 aa  261  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2328  hypothetical protein  46.09 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0534  hypothetical protein  57.95 
 
 
357 aa  204  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  54.19 
 
 
342 aa  194  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0252538 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1548  hypothetical protein  32.39 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1303  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0531274 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  32.2 
 
 
270 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  32.45 
 
 
242 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  33.15 
 
 
336 aa  102  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0452  hypothetical protein  32 
 
 
219 aa  102  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1920  hypothetical protein  32.32 
 
 
217 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1170  hypothetical protein  30.49 
 
 
222 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0259926 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0737  Protein of unknown function DUF1626  32.23 
 
 
252 aa  99.4  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000438836  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1627  hypothetical protein  34.07 
 
 
294 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00194583  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1477  hypothetical protein  36.73 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.206877  normal  0.225419 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0437  hypothetical protein  29.87 
 
 
247 aa  95.5  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1071  hypothetical protein  34.01 
 
 
317 aa  94  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  normal  0.0673929 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1977  hypothetical protein  33.33 
 
 
368 aa  92.8  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.529646  hitchhiker  0.0000143313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4139  hypothetical protein  68.75 
 
 
68 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  34.67 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1976  hypothetical protein  29.93 
 
 
339 aa  85.5  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000586901 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1072  hypothetical protein  34.58 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.304238  normal  0.0380408 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0991  hypothetical protein  27.33 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.95618  normal  0.04449 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1429  hypothetical protein  31.25 
 
 
124 aa  60.1  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.220825  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1705  hypothetical protein  23.46 
 
 
271 aa  56.6  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.594083  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  24.86 
 
 
380 aa  55.8  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0833  hypothetical protein  26.67 
 
 
197 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412312  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>