25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1685 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1685  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  734    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000183285  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1303  hypothetical protein  48.94 
 
 
297 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0531274 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1343  chromosome segregation ATPases-like  32.23 
 
 
321 aa  91.3  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  30.69 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1907  paREP7  26.95 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000000796589  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0185  paREP7  33.92 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  0.966821 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0492  hypothetical protein  31.84 
 
 
229 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.821112 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0222  hypothetical protein  32.29 
 
 
327 aa  62.8  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  30.23 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0327  paREP7  32.74 
 
 
253 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  30.26 
 
 
270 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  35.88 
 
 
305 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1548  hypothetical protein  40.4 
 
 
219 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0460  hypothetical protein  40.86 
 
 
212 aa  59.7  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  28.38 
 
 
336 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1516  hypothetical protein  62.79 
 
 
195 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000303236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  24.27 
 
 
353 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0067  hypothetical protein  45.78 
 
 
91 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.125226  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  26.19 
 
 
284 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  38.33 
 
 
242 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1695  paREP7  54.55 
 
 
226 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  28.76 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1276  hypothetical protein  29.5 
 
 
244 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.160585 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2036  hypothetical protein  29.5 
 
 
244 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1156  hypothetical protein  56.1 
 
 
149 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>