27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0492 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0492  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  449  1e-125  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.821112 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0327  paREP7  59.59 
 
 
253 aa  288  4e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0185  paREP7  59.59 
 
 
253 aa  288  7e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  0.966821 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1907  paREP7  42.81 
 
 
303 aa  194  8.000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000000796589  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  59.82 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1695  paREP7  53.51 
 
 
226 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  31.68 
 
 
317 aa  107  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1150  hypothetical protein  61.36 
 
 
254 aa  106  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal  0.0462883 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1408  paREP7  67.12 
 
 
229 aa  102  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165903  normal  0.389588 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1276  hypothetical protein  45.86 
 
 
244 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.160585 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1156  hypothetical protein  62.2 
 
 
149 aa  99.8  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2036  hypothetical protein  45.11 
 
 
244 aa  99  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1920  hypothetical protein  63.74 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1170  hypothetical protein  62.64 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0259926 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  50.56 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0460  hypothetical protein  35.08 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1685  hypothetical protein  31.84 
 
 
386 aa  65.1  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000183285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  39.78 
 
 
342 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0252538 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1548  hypothetical protein  48.61 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1343  chromosome segregation ATPases-like  37.14 
 
 
321 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2328  hypothetical protein  39.39 
 
 
256 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0971  hypothetical protein  29.44 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.801412  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  42.86 
 
 
336 aa  45.8  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  38 
 
 
380 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0067  hypothetical protein  49.09 
 
 
91 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.125226  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  32.04 
 
 
284 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>