37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0326 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  100 
 
 
194 aa  373  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0876  paREP15, putative coiled-coil protein  51.97 
 
 
150 aa  149  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0616  paREP15, putative coiled-coil protein  42.21 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1887  syntaxin domain-containing protein  36.26 
 
 
172 aa  102  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.546042 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0505  syntaxin domain-containing protein  37.36 
 
 
147 aa  94.7  8e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0045527 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1460  syntaxin domain-containing protein  44.44 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.681361  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0520  hypothetical protein  34 
 
 
137 aa  72  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0226717  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0474  syntaxin domain-containing protein  39.5 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00702361  hitchhiker  0.0000000254613 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1031  hypothetical protein  29.38 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.413291  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1513  paREP15, putative coiled-coil protein  40 
 
 
115 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.086591  normal  0.573379 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0121  paREP15, putative coiled-coil protein  31.25 
 
 
111 aa  58.5  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  29.21 
 
 
328 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2329  conserved hypothetical protein  23.9 
 
 
227 aa  55.8  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000461934  n/a   
 
 
-
 
NC_011722  BbuZS7_N30  BdrR  30.17 
 
 
184 aa  51.2  0.000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0490  paREP15, putative coiled-coil protein  27.43 
 
 
123 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3500  hypothetical protein  24.41 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0534  hypothetical protein  25.71 
 
 
357 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  26.56 
 
 
278 aa  49.3  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  48.53 
 
 
177 aa  48.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1891  PT repeat-containing protein  36.27 
 
 
330 aa  48.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.980004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1752  RepA / Rep+ protein KID  27.27 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000570014  normal  0.986546 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  28.57 
 
 
978 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  28.57 
 
 
913 aa  46.2  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2616  hypothetical protein  21.95 
 
 
188 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145924  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  34.94 
 
 
242 aa  45.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  27.81 
 
 
212 aa  45.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P30  repeat motif-containing protein  25.77 
 
 
209 aa  45.1  0.0007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0212015  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC14  repeat motif-containing protein  24.2 
 
 
213 aa  44.7  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.577398  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0521  hypothetical protein  30.77 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.16 
 
 
1012 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  24.64 
 
 
1084 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  28.04 
 
 
676 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6447  hypothetical protein  28.57 
 
 
408 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  36.47 
 
 
916 aa  41.6  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  32.61 
 
 
1333 aa  41.6  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  28.07 
 
 
143 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC60  BdrE  28.57 
 
 
210 aa  41.2  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000600085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>