44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1276 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  334  3.9999999999999995e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2365  hypothetical protein  36.9 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  33.04 
 
 
178 aa  61.6  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  27.19 
 
 
212 aa  58.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  26.58 
 
 
209 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0505  syntaxin domain-containing protein  39.77 
 
 
147 aa  55.1  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0045527 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1887  syntaxin domain-containing protein  35.71 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.546042 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1517  hypothetical protein  35.34 
 
 
148 aa  52.4  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1460  syntaxin domain-containing protein  38.64 
 
 
140 aa  51.2  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.681361  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0520  hypothetical protein  34.21 
 
 
137 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0226717  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2700  hypothetical protein  25.56 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011779  BbuZS7_G34  BdrW  29.84 
 
 
248 aa  49.3  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC14  repeat motif-containing protein  29.2 
 
 
213 aa  48.9  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.577398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1177  coiled-coil protein  26.88 
 
 
243 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  26.87 
 
 
745 aa  48.5  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1219  hypothetical protein  32.91 
 
 
567 aa  48.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000368049 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  24.37 
 
 
257 aa  47.8  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  43.02 
 
 
194 aa  47.8  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal 
 
 
-
 
NC_011722  BbuZS7_N30  BdrR  26.05 
 
 
184 aa  47.8  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1166  hypothetical protein  20.35 
 
 
136 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  35.85 
 
 
328 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4448  uncharacterized conserved protein containing internal repeats  21.98 
 
 
134 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528485  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0692  hypothetical protein  27.27 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  26.26 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0500  hypothetical protein  30.95 
 
 
619 aa  45.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.892489  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  24.24 
 
 
708 aa  45.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H16  repeat motif-containing protein  30.77 
 
 
204 aa  45.4  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.785411  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  23.46 
 
 
278 aa  45.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  26.36 
 
 
1184 aa  43.9  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0570  paREP5a  36 
 
 
127 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0876  paREP15, putative coiled-coil protein  37.14 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0119  hypothetical protein  42.35 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0739  hypothetical protein  27.4 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000044038 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  38.2 
 
 
1235 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P30  repeat motif-containing protein  28.47 
 
 
209 aa  43.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0212015  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2541  hypothetical protein  27.84 
 
 
381 aa  41.6  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.231668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2166  hypothetical protein  28.36 
 
 
117 aa  42  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  23.53 
 
 
1621 aa  42  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1891  PT repeat-containing protein  31.33 
 
 
330 aa  41.6  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.980004  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0474  syntaxin domain-containing protein  33.33 
 
 
133 aa  41.2  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00702361  hitchhiker  0.0000000254613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6447  hypothetical protein  27.27 
 
 
408 aa  41.2  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2634  minor structural protein  22.12 
 
 
1343 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P37  BdrA  29.57 
 
 
228 aa  40.8  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1151  hypothetical protein  25.32 
 
 
386 aa  40.8  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>