35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1460 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1460  syntaxin domain-containing protein  100 
 
 
140 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.681361  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1887  syntaxin domain-containing protein  73.08 
 
 
172 aa  200  6e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.546042 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0474  syntaxin domain-containing protein  80.15 
 
 
133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00702361  hitchhiker  0.0000000254613 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0505  syntaxin domain-containing protein  69.86 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0045527 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1513  paREP15, putative coiled-coil protein  72.79 
 
 
115 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.086591  normal  0.573379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0520  hypothetical protein  73.55 
 
 
137 aa  164  5e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0226717  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0121  paREP15, putative coiled-coil protein  47.29 
 
 
111 aa  100  8e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  37.74 
 
 
194 aa  87.4  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0876  paREP15, putative coiled-coil protein  53.75 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0616  paREP15, putative coiled-coil protein  30.86 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0490  paREP15, putative coiled-coil protein  38.38 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  38.64 
 
 
177 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0132  hypothetical protein  36.46 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011722  BbuZS7_N30  BdrR  32.94 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  31.33 
 
 
212 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC21  BdrE  29.47 
 
 
196 aa  47  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1752  RepA / Rep+ protein KID  36.62 
 
 
187 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000570014  normal  0.986546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  26.32 
 
 
745 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal 
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC14  repeat motif-containing protein  30.1 
 
 
213 aa  44.3  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.577398  n/a   
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P37  BdrA  34.07 
 
 
228 aa  43.9  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_011736  BbuZS7_R27  BdrP  31.11 
 
 
177 aa  43.9  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000894815  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC60  BdrE  26.67 
 
 
210 aa  43.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000600085  n/a   
 
 
-
 
NC_011735  BbuZS7_X34  BdrM  31.07 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0076991  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  32.93 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  31.46 
 
 
178 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1691  hypothetical protein  25.97 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1710  hypothetical protein  25.97 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.150562  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2365  hypothetical protein  30.95 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0692  hypothetical protein  30.39 
 
 
207 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  21.78 
 
 
1621 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0138  virulence factor Mce family protein  33.94 
 
 
381 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3254  hypothetical protein  25.74 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000011142  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1021  hypothetical protein  23.66 
 
 
277 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  40  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1817  hypothetical protein  22.63 
 
 
231 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.820651  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>