27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4028 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  100 
 
 		 745 aa  1431    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  45.79 
 
 		 708 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1151  hypothetical protein  34.46 
 
 		 386 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0617  hypothetical protein  38.53 
 
 		 226 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.492305  normal  0.391566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  36.25 
 
 		 143 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  31.03 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1652 aa  61.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1587 aa  56.6  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  28.34 
 
 		 1235 aa  53.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  28.29 
 
 		 2487 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  28.46 
 
 		 178 aa  52.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6447  hypothetical protein  26.76 
 
 		 408 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  34.67 
 
 		 212 aa  52.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  21 
 
 		 2252 aa  49.7  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1993 aa  48.5  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  26.87 
 
 		 177 aa  48.1  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  25.19 
 
 		 2327 aa  47.8  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  23.84 
 
 		 2052 aa  47.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  27.88 
 
 		 257 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  25.32 
 
 		 2331 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3252  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  21.25 
 
 		 386 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1582 aa  45.8  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  19.88 
 
 		 229 aa  45.4  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  26.84 
 
 		 3296 aa  45.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  19.45 
 
 		 7659 aa  45.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3242  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  22.32 
 
 		 370 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1460  syntaxin domain-containing protein  26.32 
 
 		 140 aa  44.3  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.681361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>