36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0616 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0616  paREP15, putative coiled-coil protein  100 
 
 
205 aa  382  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  41.94 
 
 
194 aa  109  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1887  syntaxin domain-containing protein  33.95 
 
 
172 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.546042 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0876  paREP15, putative coiled-coil protein  32.74 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0505  syntaxin domain-containing protein  30.89 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0045527 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0474  syntaxin domain-containing protein  36.79 
 
 
133 aa  67  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00702361  hitchhiker  0.0000000254613 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1460  syntaxin domain-containing protein  30.86 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.681361  normal 
 
 
-
 
NC_011722  BbuZS7_N30  BdrR  32.12 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC14  repeat motif-containing protein  33.59 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.577398  n/a   
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P37  BdrA  29.21 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0121  paREP15, putative coiled-coil protein  38.54 
 
 
111 aa  59.3  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011736  BbuZS7_R27  BdrP  29.27 
 
 
177 aa  54.7  0.0000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000894815  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3500  hypothetical protein  19.31 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0520  hypothetical protein  41.11 
 
 
137 aa  53.1  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0226717  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC21  BdrE  34.55 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC60  BdrE  30.56 
 
 
210 aa  52.8  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000600085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.53 
 
 
997 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2616  hypothetical protein  19.01 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145924  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1752  RepA / Rep+ protein KID  34 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000570014  normal  0.986546 
 
 
-
 
NC_011735  BbuZS7_X34  BdrM  32.69 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0076991  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0132  hypothetical protein  42.37 
 
 
155 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  30.23 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1817  hypothetical protein  24.45 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.820651  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1031  hypothetical protein  22.22 
 
 
183 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.413291  normal 
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P30  repeat motif-containing protein  31.16 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0212015  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1513  paREP15, putative coiled-coil protein  39.51 
 
 
115 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.086591  normal  0.573379 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  22.75 
 
 
2327 aa  48.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  24.86 
 
 
328 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0490  paREP15, putative coiled-coil protein  25.87 
 
 
123 aa  45.1  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  30.68 
 
 
2052 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011779  BbuZS7_G34  BdrW  34.09 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0521  hypothetical protein  27.97 
 
 
179 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  31.4 
 
 
361 aa  42  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1691  hypothetical protein  23.97 
 
 
146 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1710  hypothetical protein  23.97 
 
 
146 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.150562  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0644  Chromosome segregation ATPase-like protein  23.01 
 
 
450 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>