275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1771 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 361 aa  713    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  32.78 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  32.78 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  28.85 
 
 		 468 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  29.02 
 
 		 330 aa  119  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  27.76 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  30.74 
 
 		 441 aa  102  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  27.54 
 
 		 694 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  27.46 
 
 		 932 aa  94  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  30.17 
 
 		 1036 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  33.15 
 
 		 784 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  26.24 
 
 		 400 aa  86.7  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  27.44 
 
 		 400 aa  86.7  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  28.26 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  25.55 
 
 		 919 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  25.21 
 
 		 946 aa  80.5  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  44 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  27.33 
 
 		 186 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  26.46 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  24.71 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  38.46 
 
 		 485 aa  73.2  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  26.88 
 
 		 673 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0272  S-layer domain-containing protein  25.83 
 
 		 434 aa  67  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0057  S-layer domain-containing protein  28.35 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0534  S-layer domain-containing protein  24.9 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00470893  normal  0.0913053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3667  putative S-layer protein  31.71 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.290497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3425  S-layer protein  31.71 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3645  putative S-layer protein  29.17 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3695  s-layer protein  31.71 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3386  S-layer protein  29.17 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.903804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3337  S-layer protein  28.33 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  41.54 
 
 		 536 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0519  S-layer domain protein  26.26 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28861  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  36.9 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  30.22 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3321  S-layer domain-containing protein  45.28 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752822  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  46.94 
 
 		 880 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  45.28 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0903  S-layer protein  41.46 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000949153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1031  S-layer domain-containing protein  40.38 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  25.66 
 
 		 578 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000625317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  28.78 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  30.65 
 
 		 581 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.29 
 
 		 459 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  30.65 
 
 		 581 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1629  S-layer protein  35.29 
 
 		 470 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00040233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1818  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.29 
 
 		 459 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000545238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  34.52 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1019  putative S-layer protein  23.23 
 
 		 577 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0271963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  31.19 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  30.28 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  38.46 
 
 		 548 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4285  S-layer domain protein  42.31 
 
 		 577 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00013823  normal  0.102971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0881  S-layer domain-containing protein  42.31 
 
 		 578 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000484445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1939  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  36.47 
 
 		 470 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000781755  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  44 
 
 		 1821 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  30.28 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  31.19 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  37.5 
 
 		 551 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  38.46 
 
 		 575 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  38.71 
 
 		 593 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  30 
 
 		 539 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  26.83 
 
 		 629 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  31.48 
 
 		 572 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1863  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  32.94 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27744e-53 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  39.06 
 
 		 458 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  29.51 
 
 		 666 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  30.28 
 
 		 272 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  28.23 
 
 		 518 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  28.69 
 
 		 641 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0852  S-layer domain-containing protein  44 
 
 		 214 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  38.71 
 
 		 591 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  29.51 
 
 		 666 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  46 
 
 		 461 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0219  S-layer domain-containing protein  25.32 
 
 		 404 aa  53.9  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  46 
 
 		 461 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0124  s-layer protein  37.21 
 
 		 652 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  24.63 
 
 		 531 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  46 
 
 		 461 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  29.84 
 
 		 510 aa  53.9  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  35.9 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0217  S-layer domain-containing protein  25.32 
 
 		 404 aa  53.9  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  46 
 
 		 461 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1072  S-layer protein, putative  42.31 
 
 		 578 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.043499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  40.38 
 
 		 219 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  30 
 
 		 533 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  31.48 
 
 		 563 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  30 
 
 		 561 aa  53.9  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  30.33 
 
 		 513 aa  53.9  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  51.06 
 
 		 524 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  40.38 
 
 		 219 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  51.11 
 
 		 624 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  31.15 
 
 		 500 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  26.45 
 
 		 514 aa  53.1  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  27.97 
 
 		 528 aa  53.1  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  26.02 
 
 		 658 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  40 
 
 		 639 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1144  S-layer protein  42.31 
 
 		 578 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000385936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  38.46 
 
 		 862 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  38.46 
 
 		 862 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>