114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1069 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 658 aa  1315    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  46.07 
 
 		 622 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  43.71 
 
 		 581 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  41.04 
 
 		 542 aa  385  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  43.03 
 
 		 539 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  43.11 
 
 		 604 aa  356  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  41.11 
 
 		 643 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  42.71 
 
 		 563 aa  352  8.999999999999999e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  35.33 
 
 		 639 aa  347  5e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  38.44 
 
 		 574 aa  340  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  40.85 
 
 		 491 aa  332  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  36.87 
 
 		 550 aa  325  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  40.46 
 
 		 533 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  38.95 
 
 		 572 aa  324  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  40.88 
 
 		 531 aa  323  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  36.87 
 
 		 561 aa  321  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  34.16 
 
 		 581 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  34.16 
 
 		 581 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  39.43 
 
 		 624 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  38.72 
 
 		 529 aa  306  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  35.79 
 
 		 586 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  35.79 
 
 		 586 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  32.99 
 
 		 591 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  33.48 
 
 		 593 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  34.55 
 
 		 551 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  37.16 
 
 		 530 aa  292  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  37.28 
 
 		 571 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  38.74 
 
 		 629 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  38.87 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  33.82 
 
 		 600 aa  263  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  36.29 
 
 		 518 aa  261  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  36.3 
 
 		 531 aa  258  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  36.94 
 
 		 548 aa  255  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  35.43 
 
 		 543 aa  254  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  30.5 
 
 		 508 aa  251  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  32.69 
 
 		 589 aa  248  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  32.21 
 
 		 641 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  32.73 
 
 		 606 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  31.06 
 
 		 666 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  31.06 
 
 		 666 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  33.11 
 
 		 550 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  34.48 
 
 		 645 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  34.62 
 
 		 632 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  32.75 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  50.63 
 
 		 514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  32.72 
 
 		 555 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  32.71 
 
 		 561 aa  201  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  47.62 
 
 		 524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  33.57 
 
 		 500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  47.83 
 
 		 518 aa  198  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  33.33 
 
 		 543 aa  197  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  48.55 
 
 		 513 aa  194  5e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  48.19 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  48.94 
 
 		 528 aa  191  4e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  44.58 
 
 		 531 aa  175  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  28.71 
 
 		 527 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  29.54 
 
 		 568 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  40.87 
 
 		 544 aa  156  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  62.5 
 
 		 188 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  34.43 
 
 		 515 aa  112  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  33.2 
 
 		 515 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  50.62 
 
 		 261 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  29.8 
 
 		 450 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  47.19 
 
 		 262 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  47.19 
 
 		 262 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  41.49 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  30.56 
 
 		 440 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  30.36 
 
 		 415 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  32.05 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  32.3 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  32.22 
 
 		 449 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  37.96 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  32.02 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  39.29 
 
 		 946 aa  63.9  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  30.32 
 
 		 414 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  38.46 
 
 		 932 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  30.73 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  37.5 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  34.82 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  34.45 
 
 		 919 aa  57.8  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  46.67 
 
 		 1036 aa  55.5  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  43.33 
 
 		 468 aa  55.1  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  38.3 
 
 		 408 aa  54.7  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  45.45 
 
 		 343 aa  54.3  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  32.77 
 
 		 186 aa  53.9  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  26.02 
 
 		 361 aa  53.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  30.43 
 
 		 403 aa  51.6  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  30.43 
 
 		 403 aa  51.6  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  30.56 
 
 		 424 aa  50.4  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  41.07 
 
 		 400 aa  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  33.33 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  41.07 
 
 		 400 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  36.36 
 
 		 784 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  40.68 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0519  S-layer domain protein  30.47 
 
 		 466 aa  48.9  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28861  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  28.21 
 
 		 330 aa  48.9  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  42.59 
 
 		 1821 aa  48.5  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0534  S-layer domain-containing protein  29.75 
 
 		 466 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00470893  normal  0.0913053 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  37.88 
 
 		 575 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  40.68 
 
 		 414 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>