202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1096 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 403 aa  798    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 403 aa  798    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  32.78 
 
 		 361 aa  158  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  31.11 
 
 		 694 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  26.15 
 
 		 468 aa  123  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  28.6 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  27.29 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  31.84 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  25.73 
 
 		 1036 aa  98.2  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  27.99 
 
 		 932 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  25.38 
 
 		 441 aa  94.7  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  26.89 
 
 		 343 aa  86.3  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  50 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  28.34 
 
 		 919 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  30.4 
 
 		 673 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  28.04 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  61.22 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  34.4 
 
 		 946 aa  72.8  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  32.16 
 
 		 784 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  27.71 
 
 		 255 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  29.21 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0217  S-layer domain-containing protein  23.75 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0219  S-layer domain-containing protein  23.75 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0057  S-layer domain-containing protein  28.86 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3425  S-layer protein  39.39 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3337  S-layer protein  39.39 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0534  S-layer domain-containing protein  27.31 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00470893  normal  0.0913053 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3695  s-layer protein  39.39 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  35 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3321  S-layer domain-containing protein  39.39 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3667  putative S-layer protein  37.88 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.290497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0519  S-layer domain protein  26.46 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28861  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3386  S-layer protein  39.39 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.903804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3645  putative S-layer protein  39.39 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  32.56 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  44.07 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3307  S-layer domain protein  36.45 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  48 
 
 		 536 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  38.36 
 
 		 935 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  26.29 
 
 		 531 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  23.74 
 
 		 1621 aa  53.1  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  28.57 
 
 		 561 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  38.03 
 
 		 575 aa  53.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1049  S-layer protein  40.91 
 
 		 219 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250999  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  21.14 
 
 		 1193 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  19.48 
 
 		 1362 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1129  S-layer protein  40.91 
 
 		 219 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.401991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1207  putative S-layer protein  40.91 
 
 		 219 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.341169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  39.19 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  23.97 
 
 		 622 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  30.43 
 
 		 658 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  35.94 
 
 		 859 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  39.19 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  39.19 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1031  S-layer domain-containing protein  34.18 
 
 		 225 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  28.57 
 
 		 629 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0851  S-layer domain-containing protein  39.39 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  35.94 
 
 		 862 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  35.94 
 
 		 862 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2561  S-layer protein  37.84 
 
 		 189 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0213857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0790  S-layer protein, EA1 protein  35.94 
 
 		 861 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2990  S-layer protein  37.97 
 
 		 360 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  30.58 
 
 		 539 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3093  S-layer protein  37.97 
 
 		 360 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000122253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  37.84 
 
 		 461 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  40.58 
 
 		 276 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  25.38 
 
 		 524 aa  50.4  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3338  S-layer protein  37.97 
 
 		 360 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3315  putative S-layer protein  37.97 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1863  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  35.29 
 
 		 459 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27744e-53 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  25.38 
 
 		 514 aa  50.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1226  S-layer protein, putative  39.39 
 
 		 275 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  41.86 
 
 		 1821 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1027  S-layer protein  39.39 
 
 		 219 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  37.33 
 
 		 272 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1284  putative S-layer protein  39.39 
 
 		 219 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0896591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  38.6 
 
 		 266 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  45.65 
 
 		 518 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1890  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.78 
 
 		 470 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00294488  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  25.32 
 
 		 1153 aa  49.7  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  29.75 
 
 		 574 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0715  S-layer domain-containing protein  27.46 
 
 		 879 aa  49.7  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  35.56 
 
 		 219 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.23 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  42.22 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1629  S-layer protein  36.23 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00040233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  26.36 
 
 		 643 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  46.67 
 
 		 513 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  45.65 
 
 		 475 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1818  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.23 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000545238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1030  S-layer domain-containing protein  39.39 
 
 		 218 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  35.56 
 
 		 219 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  34.18 
 
 		 546 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1939  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  34.78 
 
 		 470 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000781755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1075  S-layer-like domain-containing protein  40.43 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1149  S-layer domain protein  40.43 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  45.65 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  45.65 
 
 		 528 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  45.65 
 
 		 561 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  45.65 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>