225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2990 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 932 aa  1858    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  46.44 
 
 		 919 aa  650    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  35.01 
 
 		 946 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  34.75 
 
 		 673 aa  130  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  45.2 
 
 		 424 aa  118  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  34.98 
 
 		 408 aa  115  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  37.98 
 
 		 416 aa  114  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  28.3 
 
 		 403 aa  96.3  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  28.3 
 
 		 403 aa  96.3  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  27.46 
 
 		 361 aa  95.1  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  28.85 
 
 		 694 aa  92  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  23.84 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  29.94 
 
 		 784 aa  82.8  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  24.13 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  38.18 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  47.22 
 
 		 1036 aa  76.6  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  31.54 
 
 		 255 aa  73.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  37.37 
 
 		 485 aa  73.2  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  31.28 
 
 		 186 aa  70.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  37.38 
 
 		 551 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  39.29 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  32.74 
 
 		 591 aa  68.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  37.04 
 
 		 581 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  37.38 
 
 		 641 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  36.45 
 
 		 593 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  37.04 
 
 		 581 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  36.11 
 
 		 586 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  36.11 
 
 		 586 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  26.38 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  36.54 
 
 		 539 aa  64.7  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  36.54 
 
 		 561 aa  64.3  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  36.54 
 
 		 574 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  37 
 
 		 531 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  38.46 
 
 		 629 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  34.26 
 
 		 666 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  38.46 
 
 		 658 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  34.26 
 
 		 666 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  36.19 
 
 		 639 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  36.36 
 
 		 604 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  37.5 
 
 		 578 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  34.62 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  37.5 
 
 		 622 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  36.45 
 
 		 643 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  25 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  34.29 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  47.27 
 
 		 935 aa  60.1  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  36 
 
 		 572 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  35.35 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  35.35 
 
 		 561 aa  59.7  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  35.35 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  35.44 
 
 		 536 aa  59.7  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0057  S-layer domain-containing protein  25 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  35.35 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  34.31 
 
 		 542 aa  58.9  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  36.79 
 
 		 606 aa  58.9  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  32.89 
 
 		 624 aa  58.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  34.29 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  34.34 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  35.35 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  40.85 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  34.62 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  34.34 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  34.82 
 
 		 544 aa  58.2  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  47.06 
 
 		 859 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  50 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  34.34 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  31.03 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  35.58 
 
 		 581 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4827  S-layer domain-containing protein  44.83 
 
 		 521 aa  57.4  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  34.34 
 
 		 518 aa  57.4  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  33.33 
 
 		 543 aa  57.4  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  47.06 
 
 		 862 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0790  S-layer protein, EA1 protein  47.06 
 
 		 861 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118731  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  33.33 
 
 		 530 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  47.06 
 
 		 862 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0534  S-layer domain-containing protein  27.19 
 
 		 466 aa  56.2  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00470893  normal  0.0913053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  30.56 
 
 		 550 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 		 571 aa  56.2  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  30.56 
 
 		 550 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  32.32 
 
 		 548 aa  55.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  33.33 
 
 		 518 aa  55.1  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  45.1 
 
 		 685 aa  55.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  31.73 
 
 		 632 aa  55.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  39.29 
 
 		 413 aa  54.7  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  31.73 
 
 		 645 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  31.31 
 
 		 531 aa  54.3  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  29.94 
 
 		 219 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  35.62 
 
 		 548 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  35.71 
 
 		 575 aa  53.5  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  44.23 
 
 		 760 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  42.31 
 
 		 767 aa  53.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  46.3 
 
 		 431 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1194 aa  53.5  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  44.23 
 
 		 760 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1028  S-layer protein  40.98 
 
 		 220 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.317814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  48 
 
 		 552 aa  52.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  46.67 
 
 		 629 aa  52.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.76 
 
 		 2313 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.28 
 
 		 1029 aa  52.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  41.38 
 
 		 414 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>