More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0527 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  35.24 
 
 		 1146 aa  644    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  63.7 
 
 		 1189 aa  1399    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  40.38 
 
 		 1175 aa  800    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  63.55 
 
 		 1196 aa  1318    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  63.13 
 
 		 1192 aa  1349    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1193 aa  2331    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  39.15 
 
 		 1174 aa  791    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  63.03 
 
 		 1188 aa  1372    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  39.49 
 
 		 1171 aa  735    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  36.35 
 
 		 1147 aa  630  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  35.32 
 
 		 1146 aa  624  1e-177  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1146 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  33.66 
 
 		 1149 aa  595  1e-168  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  32.47 
 
 		 1219 aa  571  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  31.38 
 
 		 1190 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  30.78 
 
 		 1184 aa  545  1e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  32.17 
 
 		 1226 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  32.42 
 
 		 1226 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  31.38 
 
 		 1217 aa  534  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  31.93 
 
 		 1198 aa  532  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  31.11 
 
 		 1208 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  32.78 
 
 		 1201 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  32.27 
 
 		 1183 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.33 
 
 		 1196 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  31.68 
 
 		 1207 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.63 
 
 		 1196 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  32.42 
 
 		 1204 aa  477  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  29.91 
 
 		 1189 aa  474  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  30.51 
 
 		 1196 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.34 
 
 		 1194 aa  476  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  30.25 
 
 		 1189 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  30.17 
 
 		 1189 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  30.35 
 
 		 1189 aa  464  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  28.47 
 
 		 1191 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  29.56 
 
 		 1172 aa  443  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.21 
 
 		 1187 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.86 
 
 		 1185 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.22 
 
 		 1191 aa  369  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  27.67 
 
 		 1189 aa  362  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  27.09 
 
 		 1189 aa  360  6e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  26.08 
 
 		 1187 aa  360  9e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.66 
 
 		 1189 aa  359  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  26.69 
 
 		 1189 aa  358  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  26.77 
 
 		 1189 aa  357  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  26.58 
 
 		 1189 aa  356  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  26.58 
 
 		 1189 aa  356  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  26.58 
 
 		 1189 aa  356  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.29 
 
 		 1190 aa  355  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  27.39 
 
 		 1189 aa  354  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  26.69 
 
 		 1189 aa  353  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  26.69 
 
 		 1189 aa  353  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  27.24 
 
 		 1189 aa  350  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  25.84 
 
 		 1188 aa  349  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  25.84 
 
 		 1188 aa  349  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  34.49 
 
 		 1184 aa  347  6e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  27.56 
 
 		 1174 aa  342  2e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  24.8 
 
 		 1185 aa  339  9.999999999999999e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  27.05 
 
 		 1187 aa  336  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  26.76 
 
 		 1191 aa  336  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  27.13 
 
 		 1177 aa  333  9e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  25.49 
 
 		 1196 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  26.1 
 
 		 1190 aa  325  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  26.06 
 
 		 1174 aa  319  2e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  27.01 
 
 		 1204 aa  319  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  25.95 
 
 		 1179 aa  318  4e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  26.16 
 
 		 1185 aa  317  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  24.24 
 
 		 1186 aa  316  9.999999999999999e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.24 
 
 		 1170 aa  316  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.26 
 
 		 1170 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  23.53 
 
 		 1174 aa  314  7.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  26.44 
 
 		 1186 aa  312  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.89 
 
 		 1164 aa  312  2.9999999999999997e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.88 
 
 		 1184 aa  311  4e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 		 1175 aa  308  3e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  25.51 
 
 		 1476 aa  308  4.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.41 
 
 		 1181 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  28.12 
 
 		 1199 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  28.2 
 
 		 1199 aa  306  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  24.7 
 
 		 1171 aa  301  4e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  28.23 
 
 		 1199 aa  301  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 		 1198 aa  298  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  27.24 
 
 		 1198 aa  298  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  25.42 
 
 		 1172 aa  297  6e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  24.39 
 
 		 1148 aa  296  2e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  26.14 
 
 		 1176 aa  294  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.56 
 
 		 1177 aa  293  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  27.07 
 
 		 1176 aa  291  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  26.04 
 
 		 1175 aa  285  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  25.95 
 
 		 1179 aa  282  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  26.12 
 
 		 1134 aa  281  4e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  24.57 
 
 		 1240 aa  281  8e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  26.65 
 
 		 1185 aa  279  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  31.41 
 
 		 1148 aa  278  3e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  26.41 
 
 		 1209 aa  278  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04180  nuclear condensin complex protein, putative  26.58 
 
 		 1215 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  25 
 
 		 1180 aa  276  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  27.43 
 
 		 1191 aa  274  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  24.58 
 
 		 1255 aa  270  8e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  24.48 
 
 		 1153 aa  270  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  25.47 
 
 		 1176 aa  269  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>