More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1158 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  37.05 
 
 		 1188 aa  689    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  36.55 
 
 		 1189 aa  685    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  36.76 
 
 		 1189 aa  685    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  36.76 
 
 		 1189 aa  685    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  36.76 
 
 		 1189 aa  683    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  36.76 
 
 		 1189 aa  684    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  36.8 
 
 		 1189 aa  686    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  37.18 
 
 		 1189 aa  702    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  37.38 
 
 		 1187 aa  753    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  36.76 
 
 		 1189 aa  683    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  37.28 
 
 		 1189 aa  709    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  37.09 
 
 		 1189 aa  711    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  38.78 
 
 		 1187 aa  728    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  37.05 
 
 		 1188 aa  689    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  36.76 
 
 		 1189 aa  683    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  36.56 
 
 		 1189 aa  690    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1187 aa  2414    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  39.5 
 
 		 1184 aa  692    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  37.52 
 
 		 1186 aa  683    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  40.29 
 
 		 1185 aa  794    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  36.75 
 
 		 1177 aa  648    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  36.04 
 
 		 1190 aa  635  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  37.32 
 
 		 1179 aa  634  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  33.73 
 
 		 1196 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  34.52 
 
 		 1174 aa  598  1e-169  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  31.79 
 
 		 1185 aa  590  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  31.56 
 
 		 1190 aa  591  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  32.33 
 
 		 1191 aa  576  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  32.02 
 
 		 1185 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  32.39 
 
 		 1198 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  32.19 
 
 		 1186 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.81 
 
 		 1190 aa  550  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  31.55 
 
 		 1204 aa  499  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  29.89 
 
 		 1176 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  30.07 
 
 		 1177 aa  492  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.01 
 
 		 1199 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  30.93 
 
 		 1199 aa  489  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  31.04 
 
 		 1199 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  29.57 
 
 		 1175 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.72 
 
 		 1173 aa  463  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 		 1176 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  31.03 
 
 		 1201 aa  453  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.1 
 
 		 1176 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  28.26 
 
 		 1172 aa  450  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  29.75 
 
 		 1255 aa  442  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  29.61 
 
 		 1185 aa  438  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.86 
 
 		 1170 aa  435  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 		 1176 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  29.85 
 
 		 1186 aa  431  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  29.6 
 
 		 1179 aa  429  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  28.79 
 
 		 1180 aa  429  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.21 
 
 		 1170 aa  423  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  30.46 
 
 		 1195 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.49 
 
 		 1178 aa  416  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.97 
 
 		 1148 aa  413  1e-113  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.28 
 
 		 1167 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.3 
 
 		 1177 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  29.25 
 
 		 1169 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.88 
 
 		 1179 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  29.21 
 
 		 1167 aa  391  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  29.19 
 
 		 1167 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  28.31 
 
 		 1175 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  28.79 
 
 		 1167 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  28.89 
 
 		 1169 aa  393  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  28.85 
 
 		 1182 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  30.23 
 
 		 1164 aa  392  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 		 1198 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  29.09 
 
 		 1164 aa  389  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  28.93 
 
 		 1190 aa  387  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  27.29 
 
 		 1178 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  28.69 
 
 		 1171 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1164 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  28.59 
 
 		 1171 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  28.56 
 
 		 1403 aa  373  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  28.31 
 
 		 1181 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1164 aa  369  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  27.56 
 
 		 1175 aa  370  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.92 
 
 		 1184 aa  368  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.18 
 
 		 1181 aa  365  4e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  26.89 
 
 		 1134 aa  355  2.9999999999999997e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.97 
 
 		 1174 aa  351  5e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  26.06 
 
 		 1193 aa  336  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  25.79 
 
 		 1174 aa  326  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  25.89 
 
 		 1189 aa  323  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  25.83 
 
 		 1189 aa  319  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  29.42 
 
 		 1308 aa  318  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  25.67 
 
 		 1189 aa  313  1e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  25.8 
 
 		 1171 aa  313  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  25.46 
 
 		 1191 aa  312  2.9999999999999997e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  25.75 
 
 		 1192 aa  298  4e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  25.56 
 
 		 1189 aa  295  5e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  27.39 
 
 		 1175 aa  294  6e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  32.66 
 
 		 1191 aa  289  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  30.15 
 
 		 1198 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  29.02 
 
 		 1301 aa  285  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  24.84 
 
 		 1172 aa  284  8.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  26.32 
 
 		 1146 aa  284  9e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  25.23 
 
 		 1175 aa  283  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  27.24 
 
 		 978 aa  282  3e-74  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  29.92 
 
 		 1194 aa  275  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>