More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0498 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  51.44 
 
 		 1178 aa  1123    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  52.24 
 
 		 1177 aa  1154    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  46.43 
 
 		 1190 aa  951    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1185 aa  2403    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  54.77 
 
 		 1186 aa  1277    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  36.63 
 
 		 1185 aa  637    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  52.72 
 
 		 1179 aa  1147    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  33.66 
 
 		 1178 aa  631  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  31.14 
 
 		 1176 aa  555  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  33.44 
 
 		 1176 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.56 
 
 		 1176 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.02 
 
 		 1187 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.69 
 
 		 1175 aa  505  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  31 
 
 		 1176 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.8 
 
 		 1173 aa  497  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  31.55 
 
 		 1187 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.25 
 
 		 1190 aa  486  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.73 
 
 		 1196 aa  480  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.67 
 
 		 1199 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.7 
 
 		 1189 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.36 
 
 		 1189 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.2 
 
 		 1189 aa  473  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  31.51 
 
 		 1199 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.28 
 
 		 1189 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.59 
 
 		 1199 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  31.05 
 
 		 1198 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  30.79 
 
 		 1177 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  30.25 
 
 		 1185 aa  469  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  30.22 
 
 		 1189 aa  465  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  29.9 
 
 		 1189 aa  466  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.3 
 
 		 1189 aa  466  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  29.9 
 
 		 1189 aa  466  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  30.22 
 
 		 1189 aa  465  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  30.22 
 
 		 1189 aa  465  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.16 
 
 		 1189 aa  458  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.5 
 
 		 1204 aa  456  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  30.27 
 
 		 1190 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  31.28 
 
 		 1191 aa  452  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.88 
 
 		 1148 aa  447  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  30.04 
 
 		 1198 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.61 
 
 		 1187 aa  443  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  28.96 
 
 		 1177 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.72 
 
 		 1188 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.8 
 
 		 1174 aa  415  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.72 
 
 		 1188 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  28.14 
 
 		 1185 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  28.54 
 
 		 1168 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  27.16 
 
 		 1189 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.75 
 
 		 1177 aa  395  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  28.81 
 
 		 1255 aa  393  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.71 
 
 		 1184 aa  391  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.75 
 
 		 1186 aa  392  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  30.05 
 
 		 1179 aa  385  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  27.8 
 
 		 1167 aa  386  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.46 
 
 		 1403 aa  379  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  29.23 
 
 		 1168 aa  379  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  28.44 
 
 		 1167 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  28.12 
 
 		 1189 aa  376  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  29.11 
 
 		 1175 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  26.83 
 
 		 1191 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  29.44 
 
 		 1175 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  28.5 
 
 		 1167 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  28.58 
 
 		 1167 aa  372  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  26.58 
 
 		 1179 aa  369  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  28.63 
 
 		 1171 aa  370  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  27.91 
 
 		 1175 aa  365  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  27.27 
 
 		 1162 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  27.68 
 
 		 1162 aa  363  8e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1164 aa  363  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  26.62 
 
 		 1169 aa  362  3e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  27.13 
 
 		 1162 aa  360  7e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  28.2 
 
 		 1174 aa  359  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  26.16 
 
 		 1169 aa  359  1.9999999999999998e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1164 aa  358  5e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  27.46 
 
 		 1171 aa  355  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  28.66 
 
 		 1190 aa  353  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  28.15 
 
 		 1204 aa  349  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  29.21 
 
 		 1182 aa  348  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  27.53 
 
 		 1308 aa  347  8e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  27.89 
 
 		 1171 aa  346  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  26.72 
 
 		 1172 aa  343  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  29.13 
 
 		 1181 aa  342  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  26.85 
 
 		 1198 aa  339  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  27.43 
 
 		 1154 aa  338  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  27.91 
 
 		 1171 aa  337  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.04 
 
 		 1181 aa  334  7.000000000000001e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  27.35 
 
 		 1154 aa  331  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 		 1170 aa  317  7e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  26.84 
 
 		 1152 aa  315  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  25.14 
 
 		 1150 aa  311  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  26.41 
 
 		 1164 aa  309  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 		 1150 aa  309  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  25.85 
 
 		 1172 aa  279  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  26.52 
 
 		 1153 aa  277  7e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  28.92 
 
 		 1301 aa  276  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.63 
 
 		 1174 aa  273  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  38.77 
 
 		 1176 aa  258  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  47.22 
 
 		 1190 aa  256  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.28 
 
 		 1176 aa  255  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  24.66 
 
 		 1174 aa  251  6e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>