More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1577 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  35.77 
 
 		 1145 aa  666    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  42.83 
 
 		 1162 aa  738    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  38.52 
 
 		 1170 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  37.81 
 
 		 1140 aa  685    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  43.43 
 
 		 1162 aa  793    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  45.19 
 
 		 1162 aa  800    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  37.49 
 
 		 1164 aa  693    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  37.52 
 
 		 1164 aa  692    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  43.71 
 
 		 1162 aa  790    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  42.91 
 
 		 1162 aa  751    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  38.28 
 
 		 1167 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  39.56 
 
 		 1141 aa  693    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  40.61 
 
 		 1139 aa  694    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  39.11 
 
 		 1171 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  40.52 
 
 		 1165 aa  677    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  42.93 
 
 		 1167 aa  808    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  43.46 
 
 		 1170 aa  796    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  42.92 
 
 		 1162 aa  765    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  42.5 
 
 		 1163 aa  795    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  37.9 
 
 		 1190 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  44 
 
 		 1167 aa  824    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  44.82 
 
 		 1162 aa  818    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  39.24 
 
 		 1175 aa  656    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  41.69 
 
 		 1168 aa  808    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  44 
 
 		 1162 aa  792    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  43.26 
 
 		 1167 aa  825    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  39.69 
 
 		 1198 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  43.17 
 
 		 1164 aa  767    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  38.62 
 
 		 1170 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  38.12 
 
 		 1171 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  37.11 
 
 		 1133 aa  660    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  38.27 
 
 		 1170 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  42.3 
 
 		 1162 aa  739    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  37.41 
 
 		 1164 aa  709    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  40.35 
 
 		 1169 aa  785    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  38.98 
 
 		 1142 aa  673    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  39.02 
 
 		 1142 aa  683    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  44.34 
 
 		 1168 aa  757    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  45.44 
 
 		 1168 aa  865    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  37.96 
 
 		 1171 aa  666    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  42.76 
 
 		 1167 aa  809    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  44.51 
 
 		 1162 aa  822    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  40.27 
 
 		 1169 aa  778    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  38.27 
 
 		 1170 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  39.83 
 
 		 1170 aa  643    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  38.94 
 
 		 1142 aa  681    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  43.31 
 
 		 1162 aa  740    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  38.38 
 
 		 1171 aa  665    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1164 aa  2275    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  38.52 
 
 		 1170 aa  633  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  39.03 
 
 		 1198 aa  635  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  38.08 
 
 		 1171 aa  632  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  38.44 
 
 		 1206 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  38.33 
 
 		 1170 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  38.44 
 
 		 1170 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  38.52 
 
 		 1170 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  38.97 
 
 		 1175 aa  627  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  38.94 
 
 		 1268 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  38.23 
 
 		 1175 aa  626  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  38.35 
 
 		 1170 aa  625  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  38.8 
 
 		 1172 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  38.35 
 
 		 1202 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  36.61 
 
 		 1173 aa  625  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  38.35 
 
 		 1200 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  38.38 
 
 		 1170 aa  621  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  37.92 
 
 		 1174 aa  617  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  38.22 
 
 		 1181 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  37.75 
 
 		 1171 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  37.78 
 
 		 1174 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  36.81 
 
 		 1182 aa  606  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  37.52 
 
 		 1142 aa  592  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  35.68 
 
 		 1152 aa  582  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  35.83 
 
 		 1167 aa  545  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  37.09 
 
 		 1150 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  37.09 
 
 		 1150 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  34.56 
 
 		 1176 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  33.52 
 
 		 1175 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  33.82 
 
 		 1177 aa  486  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  35.03 
 
 		 1199 aa  483  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  34.87 
 
 		 1199 aa  479  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  33.6 
 
 		 1176 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  34.87 
 
 		 1199 aa  479  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  32.59 
 
 		 1176 aa  473  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  33.44 
 
 		 1176 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  33.68 
 
 		 1173 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.65 
 
 		 1187 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  32.96 
 
 		 1176 aa  439  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.94 
 
 		 1185 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.22 
 
 		 1188 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  43.32 
 
 		 1165 aa  420  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.22 
 
 		 1188 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  31.8 
 
 		 1187 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29.01 
 
 		 1189 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  31.06 
 
 		 1204 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  28.2 
 
 		 1189 aa  409  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.56 
 
 		 1189 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  29.47 
 
 		 1189 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.94 
 
 		 1187 aa  404  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.56 
 
 		 1189 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  29.23 
 
 		 1189 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>