More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2543 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  36.73 
 
 
1167 aa  691    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  39.77 
 
 
1162 aa  728    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  37.52 
 
 
1169 aa  725    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  39.4 
 
 
1145 aa  690    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  40 
 
 
1162 aa  759    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  37.52 
 
 
1164 aa  674    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  39.42 
 
 
1138 aa  706    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  98.2 
 
 
1164 aa  2325    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  100 
 
 
1164 aa  2369    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  39.29 
 
 
1162 aa  748    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  39.83 
 
 
1163 aa  763    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  37.4 
 
 
1167 aa  689    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  40.45 
 
 
1170 aa  708    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  37.3 
 
 
1133 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  40.64 
 
 
1168 aa  771    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  39.62 
 
 
1138 aa  705    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  37.04 
 
 
1169 aa  735    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  37.19 
 
 
1170 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  39.05 
 
 
1138 aa  698    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  36.84 
 
 
1171 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  35.81 
 
 
1195 aa  688    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  37.02 
 
 
1170 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  38.7 
 
 
1145 aa  692    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  39.21 
 
 
1168 aa  776    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  39.87 
 
 
1162 aa  760    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  36.43 
 
 
1138 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  39.28 
 
 
1138 aa  708    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  36.83 
 
 
1164 aa  687    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  40.24 
 
 
1162 aa  743    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  38.87 
 
 
1162 aa  749    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  39.77 
 
 
1162 aa  723    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  38.78 
 
 
1164 aa  718    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  37.31 
 
 
1167 aa  679    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  38.86 
 
 
1142 aa  693    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  38.47 
 
 
1142 aa  704    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  39.36 
 
 
1168 aa  691    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  37.44 
 
 
1141 aa  642    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  38.78 
 
 
1162 aa  746    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  37.4 
 
 
1167 aa  688    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  39.97 
 
 
1162 aa  744    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  37.27 
 
 
1170 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  38.37 
 
 
1142 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  39.63 
 
 
1162 aa  729    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  36.78 
 
 
1139 aa  653    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  36.89 
 
 
1171 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  37.19 
 
 
1170 aa  635  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  36.66 
 
 
1198 aa  632  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  35.03 
 
 
1165 aa  627  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  35.4 
 
 
1171 aa  627  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  37.14 
 
 
1206 aa  628  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  36.76 
 
 
1109 aa  625  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  36.56 
 
 
1198 aa  625  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  35.9 
 
 
1171 aa  622  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  36.54 
 
 
1170 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  36.28 
 
 
1172 aa  611  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  35.71 
 
 
1175 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  35.53 
 
 
1170 aa  597  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  36.38 
 
 
1142 aa  598  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  35.22 
 
 
1175 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  36.1 
 
 
1171 aa  591  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  34.38 
 
 
1173 aa  591  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  35.44 
 
 
1182 aa  592  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  35.44 
 
 
1181 aa  585  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  35.25 
 
 
1175 aa  586  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  34.68 
 
 
1204 aa  583  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  35.86 
 
 
1171 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  34.71 
 
 
1190 aa  567  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  33.19 
 
 
1152 aa  541  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  33.69 
 
 
1167 aa  520  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.94 
 
 
1176 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.03 
 
 
1175 aa  459  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  30.54 
 
 
1176 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.54 
 
 
1176 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.41 
 
 
1176 aa  452  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  40 
 
 
1162 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  29.59 
 
 
1199 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  29.59 
 
 
1199 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  31 
 
 
1176 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.73 
 
 
1185 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.54 
 
 
1189 aa  398  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  27.65 
 
 
1148 aa  395  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.97 
 
 
1190 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  30.58 
 
 
1179 aa  389  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  28.71 
 
 
1185 aa  387  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  38.26 
 
 
1165 aa  381  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.52 
 
 
1187 aa  378  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.03 
 
 
1178 aa  370  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.67 
 
 
1170 aa  365  3e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  28.76 
 
 
1170 aa  364  5.0000000000000005e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  28.22 
 
 
1185 aa  363  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  28.99 
 
 
1174 aa  358  3.9999999999999996e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  41.64 
 
 
1268 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  41.05 
 
 
1170 aa  355  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  41.05 
 
 
1170 aa  355  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.02 
 
 
1177 aa  354  5e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  40.88 
 
 
1170 aa  353  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  40.88 
 
 
1170 aa  353  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  27.55 
 
 
1176 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  28.78 
 
 
1403 aa  353  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  40.7 
 
 
1200 aa  352  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>