More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2059 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  38.62 
 
 		 1168 aa  645    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  39.03 
 
 		 1162 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  88.35 
 
 		 1172 aa  1944    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  75.72 
 
 		 1171 aa  1696    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  88.62 
 
 		 1198 aa  1969    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  90.81 
 
 		 1170 aa  1977    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  39.1 
 
 		 1162 aa  661    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  48.87 
 
 		 1234 aa  934    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  49.6 
 
 		 1167 aa  977    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  90.98 
 
 		 1170 aa  1981    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  76.51 
 
 		 1171 aa  1732    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  49.31 
 
 		 1165 aa  943    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  90.98 
 
 		 1268 aa  2000    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  39.74 
 
 		 1162 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  97.9 
 
 		 1170 aa  2122    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  57.67 
 
 		 1174 aa  1184    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  52.73 
 
 		 1173 aa  1091    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  57.63 
 
 		 1181 aa  1195    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  90.89 
 
 		 1200 aa  1979    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  46.23 
 
 		 1190 aa  905    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  57.93 
 
 		 1174 aa  1176    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  91.51 
 
 		 1170 aa  1993    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  90.81 
 
 		 1170 aa  1978    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  38.74 
 
 		 1163 aa  653    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  58.44 
 
 		 1171 aa  1230    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  37.64 
 
 		 1168 aa  666    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  58.59 
 
 		 1170 aa  1192    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  43.23 
 
 		 1168 aa  784    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  57.71 
 
 		 1182 aa  1240    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  89.14 
 
 		 1198 aa  2003    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  52.34 
 
 		 1152 aa  1066    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  38.97 
 
 		 1164 aa  638    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  90.89 
 
 		 1202 aa  1979    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  40.86 
 
 		 1162 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  74.67 
 
 		 1171 aa  1724    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  99.56 
 
 		 1170 aa  2260    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  57.42 
 
 		 1175 aa  1179    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  38.94 
 
 		 1162 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  58.49 
 
 		 1175 aa  1245    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  97.46 
 
 		 1170 aa  2118    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  57.59 
 
 		 1175 aa  1178    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  39.2 
 
 		 1162 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  96.94 
 
 		 1206 aa  2084    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  56.18 
 
 		 1204 aa  1148    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  75.2 
 
 		 1171 aa  1658    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1142 aa  2271    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  39.9 
 
 		 1162 aa  658    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  97.37 
 
 		 1170 aa  2122    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  59.44 
 
 		 1171 aa  1222    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  97.55 
 
 		 1170 aa  2123    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  90.89 
 
 		 1170 aa  1979    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  35.69 
 
 		 1169 aa  630  1e-179  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  35.8 
 
 		 1169 aa  629  1e-179  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  39.15 
 
 		 1170 aa  623  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  38.84 
 
 		 1162 aa  625  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  37.99 
 
 		 1162 aa  622  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  38.44 
 
 		 1162 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  36.36 
 
 		 1167 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  36.59 
 
 		 1164 aa  607  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  36.6 
 
 		 1164 aa  601  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  36.96 
 
 		 1164 aa  599  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  35.98 
 
 		 1167 aa  592  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  37.17 
 
 		 1164 aa  592  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  35.94 
 
 		 1167 aa  591  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  37.08 
 
 		 1167 aa  592  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  37.18 
 
 		 1142 aa  589  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  36.8 
 
 		 1142 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  35.17 
 
 		 1195 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  37.76 
 
 		 1142 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  39.72 
 
 		 1168 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  36.09 
 
 		 1133 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  34.97 
 
 		 1139 aa  555  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.97 
 
 		 1176 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  34.09 
 
 		 1167 aa  456  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.27 
 
 		 1177 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.53 
 
 		 1176 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32 
 
 		 1176 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.36 
 
 		 1175 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  34.12 
 
 		 1199 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  33.55 
 
 		 1199 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.28 
 
 		 1173 aa  413  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  33.47 
 
 		 1199 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.12 
 
 		 1204 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.58 
 
 		 1187 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  31.88 
 
 		 1187 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.22 
 
 		 1190 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.2 
 
 		 1188 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.2 
 
 		 1188 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 		 1191 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.73 
 
 		 1403 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.23 
 
 		 1185 aa  365  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.4 
 
 		 1189 aa  365  3e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.63 
 
 		 1187 aa  365  3e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  26.77 
 
 		 1196 aa  365  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  38.24 
 
 		 1162 aa  350  8e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.11 
 
 		 1177 aa  340  7e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  27.35 
 
 		 1176 aa  331  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  27.46 
 
 		 1189 aa  330  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.86 
 
 		 1179 aa  330  1.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.41 
 
 		 1185 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>