More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0962 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  57.53 
 
 		 1175 aa  1276    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  58.32 
 
 		 1176 aa  1303    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  44.91 
 
 		 1173 aa  872    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  57.35 
 
 		 1176 aa  1283    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  38.7 
 
 		 1199 aa  682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  38.74 
 
 		 1198 aa  664    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  97.36 
 
 		 1176 aa  2230    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  37.9 
 
 		 1199 aa  676    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1176 aa  2355    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  38 
 
 		 1199 aa  676    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  52.32 
 
 		 1176 aa  1054    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  50.54 
 
 		 1177 aa  1076    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  34.43 
 
 		 1204 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32.86 
 
 		 1187 aa  598  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  36.11 
 
 		 1403 aa  591  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  33.87 
 
 		 1190 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  33.93 
 
 		 1189 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  33.63 
 
 		 1189 aa  562  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  33.98 
 
 		 1189 aa  559  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  33.63 
 
 		 1189 aa  557  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  33.98 
 
 		 1189 aa  559  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  33.28 
 
 		 1189 aa  558  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  33.55 
 
 		 1189 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  33.74 
 
 		 1189 aa  555  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  35.09 
 
 		 1187 aa  555  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  33.55 
 
 		 1189 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  33.74 
 
 		 1189 aa  556  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  34.15 
 
 		 1198 aa  553  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  32.39 
 
 		 1189 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.44 
 
 		 1196 aa  548  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  32.47 
 
 		 1190 aa  545  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  32.26 
 
 		 1185 aa  545  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  30.74 
 
 		 1191 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  33.9 
 
 		 1168 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  30.43 
 
 		 1178 aa  530  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  33.61 
 
 		 1167 aa  521  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 		 1185 aa  522  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  33.77 
 
 		 1167 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  34.04 
 
 		 1167 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  30.39 
 
 		 1185 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  33.77 
 
 		 1167 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  31.96 
 
 		 1176 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  30.93 
 
 		 1189 aa  511  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  33.87 
 
 		 1168 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  32.15 
 
 		 1185 aa  511  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  34.25 
 
 		 1162 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  31.16 
 
 		 1188 aa  505  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  31.16 
 
 		 1188 aa  505  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  33.57 
 
 		 1184 aa  489  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  31.73 
 
 		 1177 aa  485  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  31.9 
 
 		 1162 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.3 
 
 		 1186 aa  483  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  33.31 
 
 		 1164 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  31.13 
 
 		 1179 aa  478  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 		 1186 aa  474  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  31.63 
 
 		 1178 aa  476  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  31.57 
 
 		 1162 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  30.79 
 
 		 1187 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  32.54 
 
 		 1198 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  31.92 
 
 		 1186 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  31.38 
 
 		 1164 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  31.51 
 
 		 1171 aa  473  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  32.71 
 
 		 1174 aa  468  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  30.65 
 
 		 1148 aa  464  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  31.91 
 
 		 1174 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  31.46 
 
 		 1171 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  32.27 
 
 		 1198 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  32.2 
 
 		 1173 aa  459  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1164 aa  459  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1164 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  28.88 
 
 		 1177 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  32.17 
 
 		 1187 aa  452  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  31.97 
 
 		 1308 aa  449  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  32.19 
 
 		 1179 aa  447  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  31.32 
 
 		 1170 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  31.65 
 
 		 1174 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  31.04 
 
 		 1182 aa  445  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  31.25 
 
 		 1175 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  32.4 
 
 		 1191 aa  439  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  31.69 
 
 		 1179 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  32.47 
 
 		 1152 aa  432  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  31.72 
 
 		 1181 aa  428  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  31.4 
 
 		 1194 aa  430  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  30.26 
 
 		 1175 aa  424  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  30.8 
 
 		 1177 aa  425  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  31.12 
 
 		 1171 aa  422  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  27.85 
 
 		 1164 aa  386  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  29.05 
 
 		 1307 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  31.47 
 
 		 1201 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  27.14 
 
 		 1180 aa  375  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.99 
 
 		 1170 aa  369  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  29.32 
 
 		 1181 aa  365  3e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.72 
 
 		 1170 aa  359  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  24.16 
 
 		 1174 aa  353  8.999999999999999e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  34.06 
 
 		 1185 aa  337  7e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  29.23 
 
 		 1301 aa  329  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  24.79 
 
 		 1153 aa  295  3e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  27.12 
 
 		 1134 aa  291  6e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.31 
 
 		 1171 aa  279  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.55 
 
 		 1189 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>