More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3658 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  53.91 
 
 
1163 aa  1105    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  80.81 
 
 
1162 aa  1761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  80.38 
 
 
1162 aa  1768    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  40.66 
 
 
1109 aa  683    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  80.46 
 
 
1162 aa  1754    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  41.87 
 
 
1145 aa  744    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  100 
 
 
1162 aa  2321    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  39.17 
 
 
1170 aa  674    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  40.67 
 
 
1138 aa  746    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  39.92 
 
 
1164 aa  756    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  40 
 
 
1164 aa  754    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  38.36 
 
 
1175 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  97.42 
 
 
1162 aa  2187    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  39.67 
 
 
1206 aa  677    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  37.42 
 
 
1167 aa  657    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  40.64 
 
 
1138 aa  746    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  37.68 
 
 
1171 aa  685    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  38.36 
 
 
1181 aa  655    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  40.44 
 
 
1165 aa  688    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  39.77 
 
 
1268 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  48.95 
 
 
1170 aa  944    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  85.03 
 
 
1162 aa  1895    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  39.9 
 
 
1170 aa  696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  38.4 
 
 
1171 aa  689    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  39.34 
 
 
1172 aa  698    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  38.38 
 
 
1171 aa  648    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  45.07 
 
 
1169 aa  947    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  38.6 
 
 
1171 aa  701    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  38.51 
 
 
1175 aa  653    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  38.64 
 
 
1190 aa  645    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  82.19 
 
 
1162 aa  1838    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  45.24 
 
 
1167 aa  901    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  39.58 
 
 
1170 aa  697    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  39.62 
 
 
1170 aa  684    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  41.09 
 
 
1145 aa  752    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  41.3 
 
 
1140 aa  743    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  50.9 
 
 
1168 aa  1045    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 
1171 aa  649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  58.15 
 
 
1168 aa  1269    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  36.61 
 
 
1168 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  38.29 
 
 
1182 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  40.12 
 
 
1198 aa  705    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  38.17 
 
 
1174 aa  636    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  46.08 
 
 
1167 aa  925    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  47.78 
 
 
1164 aa  915    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  39.75 
 
 
1198 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  38.45 
 
 
1171 aa  707    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  40.98 
 
 
1138 aa  750    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  37.98 
 
 
1173 aa  667    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  39.67 
 
 
1170 aa  700    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  80.46 
 
 
1162 aa  1761    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  43.45 
 
 
1164 aa  862    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  45.07 
 
 
1169 aa  952    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  39.42 
 
 
1170 aa  691    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  38.18 
 
 
1175 aa  663    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  41.12 
 
 
1142 aa  755    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  41.55 
 
 
1142 aa  759    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  47.78 
 
 
1168 aa  881    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  38.99 
 
 
1142 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  78.49 
 
 
1162 aa  1759    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  41.83 
 
 
1133 aa  751    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  47.31 
 
 
1167 aa  931    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  45.32 
 
 
1167 aa  902    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  37.4 
 
 
1204 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  39.67 
 
 
1170 aa  700    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  45.76 
 
 
1165 aa  818    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  42.09 
 
 
1142 aa  763    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  78.23 
 
 
1162 aa  1755    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  76.08 
 
 
1162 aa  1660    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  43.32 
 
 
1164 aa  778    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  41.35 
 
 
1138 aa  751    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  41.47 
 
 
1139 aa  751    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  38.15 
 
 
1174 aa  634  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  37.19 
 
 
1152 aa  617  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  36.45 
 
 
1167 aa  544  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  35.29 
 
 
1150 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  35.29 
 
 
1150 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  34.1 
 
 
1177 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.7 
 
 
1176 aa  490  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.37 
 
 
1175 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  31.86 
 
 
1176 aa  489  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  33.14 
 
 
1176 aa  483  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  33.36 
 
 
1173 aa  477  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.84 
 
 
1176 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  31.69 
 
 
1176 aa  475  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.52 
 
 
1187 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  32.53 
 
 
1187 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  47.04 
 
 
1195 aa  422  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.31 
 
 
1191 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  32.43 
 
 
1153 aa  406  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28 
 
 
1148 aa  400  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  30.67 
 
 
1187 aa  402  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.1 
 
 
1190 aa  400  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  28.46 
 
 
1196 aa  396  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  40.06 
 
 
1138 aa  395  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  30.34 
 
 
1198 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  39.01 
 
 
1144 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  30.84 
 
 
1153 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  40.73 
 
 
814 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  28.9 
 
 
1170 aa  391  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>