More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2586 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  37.87 
 
 		 1170 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  47.7 
 
 		 1162 aa  908    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  48.72 
 
 		 1162 aa  985    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  39.7 
 
 		 1109 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  40.32 
 
 		 1169 aa  833    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  38.23 
 
 		 1145 aa  673    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  47.31 
 
 		 1162 aa  944    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  47.01 
 
 		 1162 aa  932    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  37.79 
 
 		 1170 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  37.01 
 
 		 1164 aa  691    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1164 aa  687    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  38.11 
 
 		 1175 aa  637    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  46.23 
 
 		 1163 aa  931    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  47.56 
 
 		 1162 aa  947    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  38.94 
 
 		 1167 aa  679    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  38.31 
 
 		 1171 aa  676    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  37.42 
 
 		 1171 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  46.84 
 
 		 1165 aa  833    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  38.68 
 
 		 1165 aa  667    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  37.87 
 
 		 1268 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  44.31 
 
 		 1170 aa  840    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  45.97 
 
 		 1162 aa  915    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1167 aa  2320    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  37.83 
 
 		 1140 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  38.47 
 
 		 1145 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  37.7 
 
 		 1202 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  37.87 
 
 		 1170 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  39.85 
 
 		 1139 aa  686    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  37.48 
 
 		 1198 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  38.2 
 
 		 1170 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  37.74 
 
 		 1133 aa  662    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  38.68 
 
 		 1141 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  75.49 
 
 		 1167 aa  1750    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  45.06 
 
 		 1168 aa  961    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  37.63 
 
 		 1170 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  37.63 
 
 		 1198 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  48.13 
 
 		 1162 aa  916    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  47.7 
 
 		 1162 aa  908    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  44.07 
 
 		 1164 aa  810    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  38.37 
 
 		 1170 aa  653    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  35.77 
 
 		 1171 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  37.71 
 
 		 1195 aa  707    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  47.78 
 
 		 1162 aa  928    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  37.88 
 
 		 1170 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  38.02 
 
 		 1164 aa  742    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  81.75 
 
 		 1167 aa  1897    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  43.6 
 
 		 1164 aa  822    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  37.7 
 
 		 1200 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  38.84 
 
 		 1142 aa  676    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  38.3 
 
 		 1142 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  45.98 
 
 		 1168 aa  832    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  47.83 
 
 		 1162 aa  918    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  40.32 
 
 		 1169 aa  839    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  38.6 
 
 		 1172 aa  663    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  48.89 
 
 		 1162 aa  988    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  49.66 
 
 		 1168 aa  1036    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  37.13 
 
 		 1171 aa  667    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  37.98 
 
 		 1170 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  39.11 
 
 		 1142 aa  691    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  37.7 
 
 		 1170 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  75.49 
 
 		 1167 aa  1751    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  36.78 
 
 		 1173 aa  633  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  37.73 
 
 		 1174 aa  621  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  37.59 
 
 		 1175 aa  619  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  36.86 
 
 		 1171 aa  618  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  37.02 
 
 		 1181 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  37.36 
 
 		 1174 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  36.77 
 
 		 1190 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  37.2 
 
 		 1171 aa  608  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  36.28 
 
 		 1182 aa  605  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  36.41 
 
 		 1175 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  36.78 
 
 		 1152 aa  594  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  33.69 
 
 		 1175 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  34.1 
 
 		 1176 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  33.25 
 
 		 1176 aa  512  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  35.47 
 
 		 1167 aa  511  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  33.25 
 
 		 1177 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  33.8 
 
 		 1173 aa  486  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  33.8 
 
 		 1150 aa  476  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  33.8 
 
 		 1150 aa  476  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.93 
 
 		 1185 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.21 
 
 		 1185 aa  427  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28.16 
 
 		 1189 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  30.59 
 
 		 1187 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.07 
 
 		 1204 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.8 
 
 		 1187 aa  416  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.34 
 
 		 1188 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.34 
 
 		 1188 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  28.72 
 
 		 1189 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.38 
 
 		 1191 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.97 
 
 		 1189 aa  406  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  28.42 
 
 		 1176 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.77 
 
 		 1189 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  28.18 
 
 		 1189 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  29.06 
 
 		 1189 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.57 
 
 		 1190 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.77 
 
 		 1189 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.06 
 
 		 1189 aa  403  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  28.18 
 
 		 1189 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  27.98 
 
 		 1185 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>