More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1814 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  77.22 
 
 
1171 aa  1732    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  58.8 
 
 
1206 aa  1247    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  58.97 
 
 
1172 aa  1246    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  38.25 
 
 
1162 aa  660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  58.8 
 
 
1170 aa  1240    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  38.38 
 
 
1162 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  48.66 
 
 
1167 aa  965    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  38.4 
 
 
1163 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  60.25 
 
 
1171 aa  1325    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  70.04 
 
 
1175 aa  1604    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  46.67 
 
 
1165 aa  897    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  60.12 
 
 
1171 aa  1305    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  58.68 
 
 
1268 aa  1243    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  38.54 
 
 
1162 aa  651    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  37.66 
 
 
1162 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  58.63 
 
 
1170 aa  1264    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  58.71 
 
 
1170 aa  1238    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  51.56 
 
 
1173 aa  1096    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  77.56 
 
 
1175 aa  1744    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1181 aa  2343    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  77.37 
 
 
1174 aa  1734    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  43.71 
 
 
1190 aa  863    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  38.42 
 
 
1162 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  58.88 
 
 
1170 aa  1247    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  58.8 
 
 
1198 aa  1265    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  50.6 
 
 
1152 aa  1031    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  58.04 
 
 
1170 aa  1248    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  73.62 
 
 
1204 aa  1662    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  78.75 
 
 
1171 aa  1805    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  38.43 
 
 
1168 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  41.91 
 
 
1168 aa  776    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  85.1 
 
 
1182 aa  1999    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  58.88 
 
 
1198 aa  1274    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  58.68 
 
 
1200 aa  1237    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  67.03 
 
 
1170 aa  1464    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  77.2 
 
 
1174 aa  1719    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  58.54 
 
 
1170 aa  1259    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  58.86 
 
 
1171 aa  1305    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  46.75 
 
 
1234 aa  908    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  58.29 
 
 
1170 aa  1254    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  73.9 
 
 
1175 aa  1657    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  40.21 
 
 
1162 aa  664    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  59.78 
 
 
1171 aa  1313    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  38.99 
 
 
1162 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  57.54 
 
 
1142 aa  1196    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  38.62 
 
 
1162 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  58.8 
 
 
1170 aa  1241    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  58.8 
 
 
1170 aa  1240    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  58.38 
 
 
1170 aa  1258    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  58.71 
 
 
1202 aa  1238    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  39.31 
 
 
1168 aa  652    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  35.73 
 
 
1169 aa  622  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  35.07 
 
 
1169 aa  621  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  37.74 
 
 
1142 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  37.24 
 
 
1142 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  37.9 
 
 
1142 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  39.02 
 
 
1164 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  36.39 
 
 
1164 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  36.66 
 
 
1167 aa  608  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  37.36 
 
 
1167 aa  600  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  36.61 
 
 
1138 aa  596  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  35.86 
 
 
1140 aa  598  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  34.03 
 
 
1195 aa  594  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  36.52 
 
 
1145 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  35.6 
 
 
1164 aa  595  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  36.44 
 
 
1138 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  37.27 
 
 
1145 aa  595  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  35.68 
 
 
1164 aa  592  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  37.32 
 
 
1141 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  35.92 
 
 
1167 aa  588  1e-166  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  35.92 
 
 
1167 aa  588  1e-166  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  36.21 
 
 
1133 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  34.74 
 
 
1150 aa  479  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  34.74 
 
 
1150 aa  479  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.41 
 
 
1177 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.78 
 
 
1176 aa  432  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.09 
 
 
1176 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 
1187 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  30.69 
 
 
1175 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  31.65 
 
 
1176 aa  416  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  29.51 
 
 
1189 aa  416  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32 
 
 
1173 aa  412  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 
1189 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.69 
 
 
1204 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  31.65 
 
 
1167 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  29.58 
 
 
1189 aa  406  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  29.34 
 
 
1189 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  29.34 
 
 
1189 aa  406  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.58 
 
 
1189 aa  406  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  29.58 
 
 
1189 aa  406  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  29.5 
 
 
1189 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  29.5 
 
 
1189 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  29.18 
 
 
1189 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29.26 
 
 
1189 aa  399  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.67 
 
 
1190 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.11 
 
 
1185 aa  392  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  28.8 
 
 
1186 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.94 
 
 
1187 aa  385  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.88 
 
 
1178 aa  372  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  27.73 
 
 
1148 aa  360  9.999999999999999e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>