More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1174 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  72.9 
 
 		 1175 aa  1680    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  47.39 
 
 		 1173 aa  921    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  57.14 
 
 		 1176 aa  1233    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1176 aa  2331    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  50.25 
 
 		 1177 aa  1053    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  40.57 
 
 		 1199 aa  703    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  60.97 
 
 		 1176 aa  1382    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  40.94 
 
 		 1199 aa  706    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  57.35 
 
 		 1176 aa  1249    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  41.03 
 
 		 1199 aa  706    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  40.28 
 
 		 1198 aa  706    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  54.28 
 
 		 1176 aa  1084    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  36.9 
 
 		 1403 aa  623  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  35.48 
 
 		 1187 aa  622  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  34.26 
 
 		 1204 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  33.77 
 
 		 1190 aa  597  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  36.7 
 
 		 1187 aa  591  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  34.15 
 
 		 1189 aa  582  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  34.07 
 
 		 1189 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  33.68 
 
 		 1189 aa  567  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.89 
 
 		 1196 aa  569  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  35.01 
 
 		 1198 aa  566  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  33.77 
 
 		 1189 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  34.29 
 
 		 1189 aa  566  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  32.1 
 
 		 1185 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  33.61 
 
 		 1189 aa  561  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  33.66 
 
 		 1189 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  33.66 
 
 		 1189 aa  561  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  33.66 
 
 		 1189 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  33.66 
 
 		 1189 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  33.61 
 
 		 1189 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.78 
 
 		 1190 aa  559  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  33.11 
 
 		 1185 aa  530  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  31.37 
 
 		 1189 aa  525  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  33.42 
 
 		 1186 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  34.58 
 
 		 1168 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  34.04 
 
 		 1167 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.87 
 
 		 1191 aa  514  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  35.02 
 
 		 1162 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  30.77 
 
 		 1188 aa  513  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  30.77 
 
 		 1188 aa  513  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  31.54 
 
 		 1179 aa  511  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  34.85 
 
 		 1162 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  33.25 
 
 		 1167 aa  509  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  29.85 
 
 		 1178 aa  506  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  31.33 
 
 		 1185 aa  509  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  31.42 
 
 		 1186 aa  506  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  30.28 
 
 		 1176 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  32.82 
 
 		 1167 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  32.82 
 
 		 1167 aa  499  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.89 
 
 		 1187 aa  496  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  32.63 
 
 		 1177 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  30.05 
 
 		 1186 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  31.84 
 
 		 1169 aa  492  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  31.84 
 
 		 1169 aa  489  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  34.04 
 
 		 1162 aa  489  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  32.63 
 
 		 1178 aa  481  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  32.71 
 
 		 1162 aa  483  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  32.35 
 
 		 1140 aa  482  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  31.99 
 
 		 1171 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  30.06 
 
 		 1148 aa  480  1e-134  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  32.53 
 
 		 1162 aa  479  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1164 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.81 
 
 		 1177 aa  479  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  33.5 
 
 		 1165 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  31.87 
 
 		 1164 aa  475  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1164 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  32.58 
 
 		 1179 aa  470  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  31.39 
 
 		 1171 aa  469  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  30.96 
 
 		 1171 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  32.02 
 
 		 1174 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  31.17 
 
 		 1198 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  31.12 
 
 		 1184 aa  458  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 		 1172 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  30.73 
 
 		 1173 aa  445  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  31.09 
 
 		 1198 aa  446  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  31.45 
 
 		 1200 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  31.48 
 
 		 1170 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  31.76 
 
 		 1170 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  31.5 
 
 		 1268 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  31.76 
 
 		 1170 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  30.8 
 
 		 1177 aa  442  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  31.46 
 
 		 1167 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  31.45 
 
 		 1202 aa  439  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  31.86 
 
 		 1170 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  31.45 
 
 		 1170 aa  439  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  31.91 
 
 		 1308 aa  435  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  31.17 
 
 		 1175 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  30.73 
 
 		 1182 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  30.12 
 
 		 1179 aa  428  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  31.95 
 
 		 1175 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  30.76 
 
 		 1174 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  30.71 
 
 		 1174 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  27.24 
 
 		 1172 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  30.71 
 
 		 1171 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  27.77 
 
 		 1191 aa  419  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  30.49 
 
 		 1181 aa  415  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  31.79 
 
 		 1201 aa  390  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  28.56 
 
 		 1164 aa  381  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  30.72 
 
 		 1170 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>