More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0781 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  35.94 
 
 		 1189 aa  654    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  37 
 
 		 1189 aa  671    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  37.19 
 
 		 1189 aa  667    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  37.12 
 
 		 1189 aa  668    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  37.35 
 
 		 1189 aa  669    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  36.04 
 
 		 1188 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  35.99 
 
 		 1189 aa  672    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  37.19 
 
 		 1189 aa  667    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  36.04 
 
 		 1188 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  36.58 
 
 		 1189 aa  672    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  37 
 
 		 1189 aa  671    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  36.51 
 
 		 1189 aa  673    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  35.86 
 
 		 1187 aa  677    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  36.83 
 
 		 1189 aa  673    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  37.6 
 
 		 1187 aa  691    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  37.12 
 
 		 1189 aa  667    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  100 
 
 		 1186 aa  2388    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  35.74 
 
 		 1185 aa  654    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  37.39 
 
 		 1187 aa  660    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  34.22 
 
 		 1190 aa  619  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  35.53 
 
 		 1174 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  34.78 
 
 		 1179 aa  609  9.999999999999999e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  34.78 
 
 		 1177 aa  609  9.999999999999999e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  35.06 
 
 		 1184 aa  582  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  33.74 
 
 		 1196 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  33.49 
 
 		 1185 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  32.69 
 
 		 1185 aa  567  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  33.57 
 
 		 1198 aa  559  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  32.8 
 
 		 1186 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  30.78 
 
 		 1190 aa  552  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  33.01 
 
 		 1191 aa  545  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  30.59 
 
 		 1176 aa  499  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  29.25 
 
 		 1175 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  31.15 
 
 		 1177 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  29.94 
 
 		 1199 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  29.37 
 
 		 1199 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  29.37 
 
 		 1199 aa  486  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  30.26 
 
 		 1191 aa  477  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  29.02 
 
 		 1176 aa  476  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  29.5 
 
 		 1176 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  29.58 
 
 		 1176 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  29.34 
 
 		 1173 aa  462  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  29.04 
 
 		 1201 aa  456  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  30.5 
 
 		 1172 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.01 
 
 		 1176 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.96 
 
 		 1204 aa  446  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  30.58 
 
 		 1181 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  28.88 
 
 		 1164 aa  424  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  29.13 
 
 		 1191 aa  426  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  28.62 
 
 		 1255 aa  421  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  29.7 
 
 		 1200 aa  422  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  27.65 
 
 		 1148 aa  422  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  28.78 
 
 		 1170 aa  416  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  28.41 
 
 		 1170 aa  412  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  29.44 
 
 		 1194 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  29.71 
 
 		 1195 aa  405  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  28.75 
 
 		 1185 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.1 
 
 		 1177 aa  394  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  28.57 
 
 		 1180 aa  393  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  28.33 
 
 		 1167 aa  392  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  28.3 
 
 		 1167 aa  389  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  27.67 
 
 		 1403 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  28.14 
 
 		 1176 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  27.26 
 
 		 1167 aa  381  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  26.98 
 
 		 1167 aa  379  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.11 
 
 		 1178 aa  379  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.34 
 
 		 1186 aa  374  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  27.07 
 
 		 1169 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  27.15 
 
 		 1169 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  28.58 
 
 		 1182 aa  373  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.7 
 
 		 1179 aa  369  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.69 
 
 		 1184 aa  347  8e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  25.83 
 
 		 1171 aa  327  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  26.73 
 
 		 1174 aa  323  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  26.41 
 
 		 1174 aa  321  6e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  29.88 
 
 		 978 aa  308  5.0000000000000004e-82  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  26.39 
 
 		 1189 aa  296  2e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  31.21 
 
 		 1175 aa  290  9e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  25.99 
 
 		 1308 aa  290  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  24.66 
 
 		 1192 aa  278  5e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  25.75 
 
 		 1189 aa  278  6e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  28.47 
 
 		 1185 aa  276  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 		 1189 aa  275  3e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  25.77 
 
 		 1189 aa  274  6e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  25.73 
 
 		 1147 aa  271  7e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  24.88 
 
 		 1226 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  24.79 
 
 		 1226 aa  267  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  24.62 
 
 		 1190 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  25.57 
 
 		 1146 aa  259  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  41.02 
 
 		 1190 aa  258  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  28.07 
 
 		 1301 aa  256  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  29.94 
 
 		 1194 aa  252  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  51.11 
 
 		 1185 aa  246  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  50.67 
 
 		 1185 aa  244  7e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  27.37 
 
 		 1178 aa  241  8e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  23.7 
 
 		 1217 aa  239  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  23.02 
 
 		 1219 aa  237  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  30.06 
 
 		 1224 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  25.81 
 
 		 1146 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28.55 
 
 		 1134 aa  235  5e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>