More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4188 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  54.23 
 
 		 1191 aa  1088    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  52.39 
 
 		 1186 aa  927    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  51.2 
 
 		 1191 aa  915    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  66.58 
 
 		 1194 aa  1390    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  39.63 
 
 		 1172 aa  657    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  52.37 
 
 		 1183 aa  947    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  83.93 
 
 		 1195 aa  1741    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  49.1 
 
 		 1213 aa  880    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  39.73 
 
 		 1225 aa  690    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  59 
 
 		 1199 aa  1202    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  51.87 
 
 		 1191 aa  962    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  49.15 
 
 		 1217 aa  892    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1194 aa  2331    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  50.52 
 
 		 1222 aa  930    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  92.38 
 
 		 1194 aa  1993    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  57.1 
 
 		 1214 aa  1088    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  75.93 
 
 		 1205 aa  1616    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  54.94 
 
 		 1198 aa  1057    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  55.9 
 
 		 1198 aa  1070    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  66.53 
 
 		 1217 aa  1388    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  50.95 
 
 		 1203 aa  925    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  84.13 
 
 		 1195 aa  1748    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  59.53 
 
 		 1194 aa  1233    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  51.75 
 
 		 1195 aa  949    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  50.75 
 
 		 1181 aa  892    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  50.53 
 
 		 1222 aa  934    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  52.44 
 
 		 1224 aa  1071    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  52.96 
 
 		 1188 aa  931    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  56.73 
 
 		 1188 aa  916    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  52.62 
 
 		 1188 aa  1046    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  84.13 
 
 		 1195 aa  1748    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.47 
 
 		 1190 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  51.46 
 
 		 1227 aa  516  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  50.57 
 
 		 1218 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 		 1187 aa  502  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.94 
 
 		 1190 aa  488  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  32.83 
 
 		 1187 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  33.36 
 
 		 1175 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  34.66 
 
 		 1190 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.78 
 
 		 1176 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.65 
 
 		 1189 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.3 
 
 		 1186 aa  459  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  27.68 
 
 		 1196 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.1 
 
 		 1176 aa  452  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.42 
 
 		 1188 aa  449  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.42 
 
 		 1188 aa  449  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.12 
 
 		 1185 aa  445  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  28.83 
 
 		 1185 aa  434  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.76 
 
 		 1174 aa  432  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  67.73 
 
 		 1234 aa  425  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.31 
 
 		 1186 aa  417  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.58 
 
 		 1185 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  31.43 
 
 		 1199 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.32 
 
 		 1199 aa  396  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.25 
 
 		 1199 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.16 
 
 		 1177 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  29.71 
 
 		 1162 aa  356  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  60.26 
 
 		 1263 aa  356  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.81 
 
 		 1167 aa  348  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  25.99 
 
 		 1170 aa  348  5e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.34 
 
 		 1181 aa  346  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.3 
 
 		 1164 aa  332  3e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.48 
 
 		 1174 aa  311  4e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  30.92 
 
 		 1185 aa  308  3e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  31.78 
 
 		 1186 aa  308  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  32.38 
 
 		 1187 aa  308  6e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28.83 
 
 		 1134 aa  303  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  22.2 
 
 		 1153 aa  302  3e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  32.2 
 
 		 1189 aa  295  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  30.46 
 
 		 1198 aa  295  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31.61 
 
 		 1189 aa  295  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  45.93 
 
 		 1184 aa  294  7e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  43.37 
 
 		 1174 aa  287  9e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  33.2 
 
 		 1301 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.32 
 
 		 1191 aa  285  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.75 
 
 		 1189 aa  284  7.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.29 
 
 		 1177 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  28.87 
 
 		 1178 aa  267  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.44 
 
 		 1179 aa  261  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  46.95 
 
 		 1081 aa  258  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  25.34 
 
 		 1149 aa  251  7e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  54.93 
 
 		 1189 aa  250  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  54.93 
 
 		 1189 aa  249  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  54.46 
 
 		 1189 aa  249  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  54.46 
 
 		 1189 aa  249  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  54.46 
 
 		 1189 aa  249  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  54.46 
 
 		 1189 aa  249  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  25.04 
 
 		 1219 aa  249  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  54.93 
 
 		 1189 aa  249  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  54.46 
 
 		 1189 aa  249  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  22.92 
 
 		 1189 aa  248  6e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  55.39 
 
 		 1187 aa  247  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  31.51 
 
 		 1185 aa  245  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  24.56 
 
 		 1190 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  40.3 
 
 		 1162 aa  238  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  40 
 
 		 1162 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  30.74 
 
 		 1163 aa  237  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  40 
 
 		 1162 aa  235  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  28.51 
 
 		 1191 aa  235  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  40.91 
 
 		 1162 aa  235  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>