More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0025 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  40.84 
 
 
1149 aa  825    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  45.8 
 
 
1147 aa  936    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1146 aa  2320    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  48.31 
 
 
1146 aa  1004    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  46.38 
 
 
1146 aa  972    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  35.2 
 
 
1188 aa  632  1e-179  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  33.92 
 
 
1174 aa  621  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  33.98 
 
 
1192 aa  598  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  33.61 
 
 
1175 aa  590  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 
1193 aa  581  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  32.28 
 
 
1189 aa  569  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  34.43 
 
 
1171 aa  554  1e-156  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  33.69 
 
 
1196 aa  535  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  32.22 
 
 
1190 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 
1217 aa  475  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  30.46 
 
 
1208 aa  473  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  31.34 
 
 
1226 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  31.24 
 
 
1226 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  30.14 
 
 
1184 aa  456  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  29.14 
 
 
1189 aa  410  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 
1204 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  29.12 
 
 
1196 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  29.09 
 
 
1189 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  29.14 
 
 
1196 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  27.99 
 
 
1172 aa  395  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  29.64 
 
 
1207 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  27.42 
 
 
1191 aa  379  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  27.62 
 
 
1201 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.97 
 
 
1187 aa  362  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  31.87 
 
 
1219 aa  333  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  24.48 
 
 
1189 aa  303  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  25.36 
 
 
1190 aa  300  9e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  24.43 
 
 
1189 aa  300  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  23.49 
 
 
1188 aa  298  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  23.49 
 
 
1188 aa  298  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  24.01 
 
 
1189 aa  297  7e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  24.42 
 
 
1189 aa  295  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  23.9 
 
 
1189 aa  291  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  30.28 
 
 
1148 aa  286  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.51 
 
 
1191 aa  286  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.63 
 
 
1177 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  24.88 
 
 
1196 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  26.32 
 
 
1187 aa  284  7.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  25.8 
 
 
1185 aa  283  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  26.21 
 
 
1199 aa  281  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  23.6 
 
 
1189 aa  281  5e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  24.96 
 
 
1174 aa  281  5e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  25.42 
 
 
1198 aa  280  9e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  25.86 
 
 
1199 aa  280  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  31.4 
 
 
1194 aa  279  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  25.18 
 
 
1185 aa  273  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  25.37 
 
 
1177 aa  272  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  25.8 
 
 
1177 aa  270  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  24.98 
 
 
1176 aa  270  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  25.3 
 
 
1174 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  24.88 
 
 
1184 aa  264  8.999999999999999e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  25.1 
 
 
1176 aa  261  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  25.52 
 
 
1191 aa  261  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.15 
 
 
1181 aa  258  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  25.1 
 
 
1179 aa  258  5e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  25.16 
 
 
1190 aa  257  9e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.57 
 
 
1186 aa  256  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.61 
 
 
1170 aa  254  5.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  25 
 
 
1209 aa  254  7e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.28 
 
 
1170 aa  251  4e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  29.16 
 
 
1196 aa  244  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  24.49 
 
 
1476 aa  243  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  24.15 
 
 
1153 aa  241  5e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  27.43 
 
 
1189 aa  240  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  23.06 
 
 
1178 aa  239  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.55 
 
 
1164 aa  236  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  23.51 
 
 
1173 aa  231  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.84 
 
 
1180 aa  228  7e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  24.3 
 
 
1215 aa  226  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  25.2 
 
 
1179 aa  222  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44165  predicted protein  24.66 
 
 
1356 aa  220  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  24.31 
 
 
1208 aa  220  1e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  23.34 
 
 
1148 aa  218  5.9999999999999996e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  23.38 
 
 
1169 aa  218  7e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  24.8 
 
 
1177 aa  217  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_242  predicted protein  25.08 
 
 
1224 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  24.85 
 
 
1403 aa  213  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  23.21 
 
 
1169 aa  212  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  23.9 
 
 
1082 aa  211  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  24.92 
 
 
1224 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  34.76 
 
 
1198 aa  209  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  22.52 
 
 
1176 aa  206  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  23.54 
 
 
1186 aa  200  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  25.37 
 
 
1186 aa  199  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  24.94 
 
 
1189 aa  198  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  24.94 
 
 
1189 aa  198  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  24.82 
 
 
1189 aa  198  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  24.82 
 
 
1189 aa  198  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  24.82 
 
 
1189 aa  197  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  22.83 
 
 
1185 aa  197  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  24.82 
 
 
1189 aa  195  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  26.08 
 
 
1185 aa  193  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  47.28 
 
 
1195 aa  192  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  25.36 
 
 
1185 aa  185  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  26.19 
 
 
1185 aa  184  8.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>