More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1970 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  33.93 
 
 
1189 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  34.36 
 
 
1189 aa  647    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  34.06 
 
 
1189 aa  646    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  33.93 
 
 
1189 aa  642    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  33.9 
 
 
1189 aa  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  33.98 
 
 
1189 aa  644    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  36.64 
 
 
1185 aa  640    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  34.09 
 
 
1189 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  34.29 
 
 
1189 aa  651    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  39.52 
 
 
1196 aa  730    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  33.98 
 
 
1198 aa  664    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  33.9 
 
 
1189 aa  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  34.43 
 
 
1186 aa  643    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  38.29 
 
 
1190 aa  735    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  36.52 
 
 
1187 aa  713    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  34.06 
 
 
1189 aa  646    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  34.09 
 
 
1189 aa  652    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1185 aa  2293    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  98.06 
 
 
1185 aa  2256    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  35.55 
 
 
1188 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  33.22 
 
 
1190 aa  659    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  37.65 
 
 
1190 aa  694    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  34.82 
 
 
1187 aa  672    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  35.55 
 
 
1188 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  34.84 
 
 
1189 aa  633  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  33.17 
 
 
1187 aa  610  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  34.77 
 
 
1179 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  32.62 
 
 
1174 aa  605  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  34.64 
 
 
1185 aa  599  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  33.33 
 
 
1177 aa  596  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  34.52 
 
 
1191 aa  568  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  34.35 
 
 
1177 aa  568  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.37 
 
 
1175 aa  549  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  31.36 
 
 
1186 aa  547  1e-154  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.85 
 
 
1176 aa  537  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  33.39 
 
 
1184 aa  539  1e-151  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.44 
 
 
1176 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  29.71 
 
 
1187 aa  525  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.62 
 
 
1176 aa  526  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  30.95 
 
 
1199 aa  523  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  30.87 
 
 
1199 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  31.31 
 
 
1199 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  29.92 
 
 
1191 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  29.5 
 
 
1177 aa  501  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.53 
 
 
1204 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  28.27 
 
 
1173 aa  493  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  28.33 
 
 
1301 aa  477  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  28.54 
 
 
1255 aa  474  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  31.93 
 
 
1164 aa  458  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  30.92 
 
 
1148 aa  451  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  29.84 
 
 
1179 aa  446  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  26.92 
 
 
1201 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  30.93 
 
 
1178 aa  426  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1181 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  30.27 
 
 
1170 aa  414  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  28.56 
 
 
1185 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  28.9 
 
 
1176 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  28.8 
 
 
1174 aa  408  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.89 
 
 
1170 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  26.34 
 
 
1403 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  29.96 
 
 
1179 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  26.7 
 
 
1168 aa  402  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  30.78 
 
 
1180 aa  398  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.63 
 
 
1186 aa  399  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  27.1 
 
 
1169 aa  400  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  26.93 
 
 
1169 aa  396  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  25.82 
 
 
1198 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  27.78 
 
 
1190 aa  379  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  27.61 
 
 
1164 aa  372  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  25.28 
 
 
1167 aa  372  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  25.29 
 
 
1164 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  25.72 
 
 
1175 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  27.71 
 
 
1164 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 
1167 aa  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  26.28 
 
 
1164 aa  365  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  30.22 
 
 
1153 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  24.6 
 
 
1167 aa  364  7.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  24.6 
 
 
1167 aa  363  1e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  25.73 
 
 
1167 aa  363  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  25.91 
 
 
1268 aa  363  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  24.5 
 
 
1164 aa  362  3e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  28.43 
 
 
1184 aa  360  9e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  26.39 
 
 
1174 aa  332  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  29.48 
 
 
1191 aa  323  9.999999999999999e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  28.48 
 
 
1189 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  24.38 
 
 
1134 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  28.16 
 
 
1189 aa  320  1e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  26.51 
 
 
1308 aa  316  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  28.24 
 
 
1189 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.3 
 
 
1171 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.8 
 
 
1188 aa  312  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  26.18 
 
 
1175 aa  312  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  27.64 
 
 
1189 aa  307  7e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  24.67 
 
 
1149 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  32.16 
 
 
1175 aa  302  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  28.37 
 
 
1189 aa  294  7e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  28.23 
 
 
1185 aa  293  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  24.4 
 
 
1146 aa  291  7e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  27.52 
 
 
1198 aa  287  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  27.75 
 
 
1189 aa  285  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.430738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>