More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2130 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1175 aa  2263    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  44.11 
 
 		 1180 aa  808    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  31.77 
 
 		 1190 aa  488  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31 
 
 		 1187 aa  479  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 		 1190 aa  475  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.12 
 
 		 1188 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29 
 
 		 1185 aa  463  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.12 
 
 		 1188 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  30.23 
 
 		 1189 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29.37 
 
 		 1189 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.21 
 
 		 1189 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  30.23 
 
 		 1191 aa  459  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  29.49 
 
 		 1189 aa  452  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  29.31 
 
 		 1189 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  29.25 
 
 		 1189 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  29.31 
 
 		 1189 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  29.49 
 
 		 1189 aa  452  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  29.34 
 
 		 1189 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.17 
 
 		 1189 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  29.25 
 
 		 1189 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.92 
 
 		 1196 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  29.02 
 
 		 1189 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  28.12 
 
 		 1186 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  27.91 
 
 		 1198 aa  432  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  30.62 
 
 		 1185 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  30.16 
 
 		 1179 aa  425  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  27.8 
 
 		 1187 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.43 
 
 		 1177 aa  423  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  27.39 
 
 		 1199 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  27.44 
 
 		 1199 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  27.61 
 
 		 1199 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.33 
 
 		 1174 aa  414  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  27.24 
 
 		 1191 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.73 
 
 		 1177 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  27.41 
 
 		 1177 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  28.41 
 
 		 1176 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  26.26 
 
 		 1173 aa  379  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  31.04 
 
 		 1164 aa  377  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  28.16 
 
 		 1176 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.5 
 
 		 1181 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  26.85 
 
 		 1176 aa  377  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.23 
 
 		 1148 aa  365  4e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.68 
 
 		 1186 aa  363  9e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  29.45 
 
 		 1174 aa  362  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  28.01 
 
 		 1178 aa  360  7e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  26.46 
 
 		 1199 aa  358  2.9999999999999997e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  27.09 
 
 		 1176 aa  355  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  26.66 
 
 		 1179 aa  352  2e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  27.64 
 
 		 1178 aa  352  3e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  27.67 
 
 		 1184 aa  349  2e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  25.85 
 
 		 1175 aa  348  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  30.87 
 
 		 1153 aa  346  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  26.95 
 
 		 1179 aa  341  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  26.54 
 
 		 1189 aa  324  6e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  31.13 
 
 		 1184 aa  316  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  25.08 
 
 		 1193 aa  314  6.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  26.59 
 
 		 1172 aa  311  5.9999999999999995e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  31.42 
 
 		 1185 aa  306  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 		 1190 aa  304  8.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  23.82 
 
 		 1171 aa  292  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  34.02 
 
 		 1172 aa  290  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  25.32 
 
 		 1146 aa  287  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  28.9 
 
 		 1082 aa  282  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  25.3 
 
 		 1146 aa  281  3e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  27.61 
 
 		 1187 aa  281  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  32.09 
 
 		 1186 aa  281  5e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  25.45 
 
 		 1149 aa  277  9e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  22.42 
 
 		 1134 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  24.18 
 
 		 1403 aa  272  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  28.03 
 
 		 1301 aa  269  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  25.59 
 
 		 1146 aa  268  5e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.88 
 
 		 1196 aa  260  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  25.94 
 
 		 1185 aa  259  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  26.01 
 
 		 1194 aa  258  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  23.86 
 
 		 1217 aa  257  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  27.06 
 
 		 1196 aa  256  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  27.1 
 
 		 1255 aa  253  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  27.66 
 
 		 1196 aa  253  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  24.36 
 
 		 1147 aa  252  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  26.57 
 
 		 1148 aa  247  8e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  23.81 
 
 		 1208 aa  245  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0495  structural maintenance of chromosomes (SMC) superfamily protein  30.49 
 
 		 988 aa  234  6e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.210313  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  28.37 
 
 		 1174 aa  234  8.000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  23.83 
 
 		 1174 aa  233  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.24 
 
 		 1207 aa  231  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  46.12 
 
 		 1185 aa  230  9e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  26.02 
 
 		 1205 aa  229  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  45.74 
 
 		 1185 aa  229  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  26.14 
 
 		 1175 aa  227  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  28.86 
 
 		 1185 aa  225  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  25.69 
 
 		 1191 aa  224  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  35.19 
 
 		 1081 aa  224  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  24.57 
 
 		 1183 aa  223  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  25.79 
 
 		 1224 aa  223  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  27.82 
 
 		 1177 aa  222  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  25.92 
 
 		 1198 aa  221  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  40.91 
 
 		 1188 aa  219  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  27.52 
 
 		 1194 aa  218  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  26.12 
 
 		 1198 aa  217  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  26.86 
 
 		 1225 aa  217  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>