More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1719 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1204 aa  2453    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  35.81 
 
 
1175 aa  635  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  35.52 
 
 
1199 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  35.6 
 
 
1199 aa  631  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  35.27 
 
 
1199 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  34.48 
 
 
1176 aa  626  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  34.66 
 
 
1198 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  34.48 
 
 
1176 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  34.62 
 
 
1176 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  35.03 
 
 
1177 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  34.4 
 
 
1176 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  34.86 
 
 
1176 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  34.32 
 
 
1173 aa  588  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.35 
 
 
1187 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  31.78 
 
 
1190 aa  539  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  30.59 
 
 
1191 aa  526  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  31.03 
 
 
1189 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  32.43 
 
 
1187 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.45 
 
 
1196 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  31.15 
 
 
1189 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  31.55 
 
 
1187 aa  513  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.08 
 
 
1190 aa  515  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.96 
 
 
1189 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.72 
 
 
1189 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  30.78 
 
 
1189 aa  503  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.62 
 
 
1189 aa  501  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.7 
 
 
1189 aa  503  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  30.78 
 
 
1189 aa  503  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  30.62 
 
 
1189 aa  499  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  30.54 
 
 
1189 aa  499  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  30.62 
 
 
1189 aa  499  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.7 
 
 
1403 aa  486  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  30.31 
 
 
1198 aa  485  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 
1188 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 
1188 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.25 
 
 
1185 aa  479  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.54 
 
 
1185 aa  479  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  31.51 
 
 
1168 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  29.02 
 
 
1179 aa  466  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  29.07 
 
 
1189 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  28.75 
 
 
1177 aa  459  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  30.06 
 
 
1162 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  31.26 
 
 
1162 aa  455  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  28.49 
 
 
1185 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  29.12 
 
 
1178 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  30.23 
 
 
1162 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  29.28 
 
 
1185 aa  451  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  30.96 
 
 
1168 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.95 
 
 
1184 aa  450  1e-125  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.87 
 
 
1186 aa  453  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.52 
 
 
1186 aa  452  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  29.61 
 
 
1186 aa  445  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  29.03 
 
 
1175 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  29.84 
 
 
1171 aa  436  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  29.21 
 
 
1198 aa  435  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.73 
 
 
1178 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  29.58 
 
 
1167 aa  432  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  29.47 
 
 
1172 aa  433  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  29.61 
 
 
1167 aa  433  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  29.08 
 
 
1173 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.32 
 
 
1167 aa  429  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  28.76 
 
 
1171 aa  429  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  29.44 
 
 
1170 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  29.44 
 
 
1170 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  29.52 
 
 
1170 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  28.43 
 
 
1170 aa  425  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.25 
 
 
1177 aa  425  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  29.35 
 
 
1170 aa  426  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  29.43 
 
 
1198 aa  425  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  28.79 
 
 
1174 aa  424  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  28.83 
 
 
1182 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  29.1 
 
 
1164 aa  419  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 
1148 aa  417  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  28.41 
 
 
1175 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  26.95 
 
 
1176 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29 
 
 
1177 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  29.34 
 
 
1164 aa  415  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 
1167 aa  415  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  28.56 
 
 
1171 aa  416  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  27.66 
 
 
1175 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  27.72 
 
 
1169 aa  413  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  28.71 
 
 
1268 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  27.92 
 
 
1174 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  28.67 
 
 
1171 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  27.9 
 
 
1174 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  29.43 
 
 
1179 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  27.9 
 
 
1164 aa  400  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  27.8 
 
 
1181 aa  402  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  29.21 
 
 
1142 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  28.71 
 
 
1152 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.41 
 
 
1170 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  29.4 
 
 
1170 aa  395  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  29.12 
 
 
1174 aa  395  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  29.26 
 
 
1167 aa  387  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  29.06 
 
 
1181 aa  383  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  27.27 
 
 
1180 aa  372  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  27.84 
 
 
1201 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  26.78 
 
 
1172 aa  365  3e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  28 
 
 
1308 aa  357  7.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  26.24 
 
 
1174 aa  344  7e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>