More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1084 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  42.7 
 
 		 1188 aa  884    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  58.33 
 
 		 1189 aa  1363    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  37.3 
 
 		 1196 aa  727    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  43.34 
 
 		 1189 aa  909    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  58.59 
 
 		 1189 aa  1358    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  36.99 
 
 		 1179 aa  708    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  34.69 
 
 		 1185 aa  675    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  58.75 
 
 		 1189 aa  1358    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  58.84 
 
 		 1189 aa  1360    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  58.92 
 
 		 1189 aa  1365    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1187 aa  2396    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  58.42 
 
 		 1189 aa  1365    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  39.78 
 
 		 1190 aa  811    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  42.7 
 
 		 1188 aa  884    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  58.59 
 
 		 1189 aa  1358    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  37.01 
 
 		 1191 aa  716    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  58.75 
 
 		 1189 aa  1358    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  34.66 
 
 		 1185 aa  700    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  35.19 
 
 		 1187 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  58.25 
 
 		 1189 aa  1377    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  38.44 
 
 		 1198 aa  738    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  71.78 
 
 		 1187 aa  1679    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  37.69 
 
 		 1186 aa  707    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  37.38 
 
 		 1187 aa  753    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  37.36 
 
 		 1190 aa  759    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  41.2 
 
 		 1190 aa  829    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  35.1 
 
 		 1174 aa  687    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  36.41 
 
 		 1184 aa  650    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  35.86 
 
 		 1186 aa  678    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  37.6 
 
 		 1185 aa  774    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  37.56 
 
 		 1177 aa  715    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  58.84 
 
 		 1189 aa  1359    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  58.42 
 
 		 1189 aa  1387    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  34.17 
 
 		 1177 aa  623  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  35.48 
 
 		 1176 aa  622  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  34.14 
 
 		 1175 aa  612  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  34.34 
 
 		 1177 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  33.87 
 
 		 1176 aa  600  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.78 
 
 		 1176 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.58 
 
 		 1176 aa  580  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  33.12 
 
 		 1191 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  33.71 
 
 		 1199 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.71 
 
 		 1173 aa  570  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  33.73 
 
 		 1199 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  32.84 
 
 		 1199 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  32.49 
 
 		 1185 aa  550  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  31.24 
 
 		 1204 aa  539  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 		 1148 aa  525  1e-147  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  32.13 
 
 		 1255 aa  520  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  30.52 
 
 		 1185 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  31.37 
 
 		 1201 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  29.71 
 
 		 1178 aa  496  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  31.44 
 
 		 1179 aa  495  9.999999999999999e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  32.04 
 
 		 1186 aa  491  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  30.53 
 
 		 1164 aa  490  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  30.97 
 
 		 1181 aa  488  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  31.54 
 
 		 1177 aa  488  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  29.97 
 
 		 1174 aa  479  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  31.34 
 
 		 1188 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  30.82 
 
 		 1194 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  29.78 
 
 		 1178 aa  469  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  32.57 
 
 		 1162 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  30.36 
 
 		 1179 aa  462  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  30.13 
 
 		 1190 aa  456  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  30.78 
 
 		 1175 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  28.54 
 
 		 1176 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.35 
 
 		 1403 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  29.77 
 
 		 1180 aa  443  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  30.35 
 
 		 1164 aa  446  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  31.05 
 
 		 1168 aa  438  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  30.06 
 
 		 1142 aa  439  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  28.65 
 
 		 1195 aa  435  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  29.34 
 
 		 1170 aa  435  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  30.05 
 
 		 1170 aa  435  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  29.27 
 
 		 1167 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1167 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  29.67 
 
 		 1162 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.99 
 
 		 1169 aa  426  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  28.59 
 
 		 1169 aa  425  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  29.59 
 
 		 1164 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  29.99 
 
 		 1144 aa  426  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  29.64 
 
 		 1162 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  30.22 
 
 		 1175 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  30.17 
 
 		 1174 aa  423  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  29.87 
 
 		 1182 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  30.13 
 
 		 1175 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  29.8 
 
 		 1153 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  29.86 
 
 		 1171 aa  419  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  29.67 
 
 		 1171 aa  415  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  29.36 
 
 		 1190 aa  415  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  30.52 
 
 		 1171 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  29.88 
 
 		 1174 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  28.01 
 
 		 1167 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  28.99 
 
 		 1198 aa  413  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  29.83 
 
 		 1175 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  28.9 
 
 		 1167 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  27.88 
 
 		 1184 aa  399  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  29.35 
 
 		 1204 aa  392  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28.83 
 
 		 1134 aa  392  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  27.16 
 
 		 1171 aa  393  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>