More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0643 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  34.85 
 
 		 1178 aa  641    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  36.82 
 
 		 1185 aa  666    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  38.79 
 
 		 1177 aa  667    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1185 aa  2302    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  38 
 
 		 1186 aa  686    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  36.81 
 
 		 1179 aa  649    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  32.87 
 
 		 1178 aa  624  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  36.73 
 
 		 1190 aa  599  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32.49 
 
 		 1187 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  33.17 
 
 		 1176 aa  582  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  36.23 
 
 		 1173 aa  571  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  36.5 
 
 		 1176 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  31.09 
 
 		 1191 aa  562  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  33.84 
 
 		 1176 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  31.06 
 
 		 1190 aa  547  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  33.5 
 
 		 1187 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  33.52 
 
 		 1176 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.83 
 
 		 1196 aa  539  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  31.5 
 
 		 1189 aa  537  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  32.6 
 
 		 1186 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  31.87 
 
 		 1176 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  35.2 
 
 		 1175 aa  529  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31.07 
 
 		 1189 aa  528  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  34.59 
 
 		 1199 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1190 aa  524  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  31.11 
 
 		 1189 aa  525  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  35.23 
 
 		 1177 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  31.57 
 
 		 1189 aa  525  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  31.77 
 
 		 1189 aa  520  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  31.77 
 
 		 1189 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  34.63 
 
 		 1199 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  34.55 
 
 		 1199 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  31.44 
 
 		 1189 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  31.61 
 
 		 1189 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  31.44 
 
 		 1189 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  31.44 
 
 		 1189 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  31.39 
 
 		 1189 aa  516  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  34.29 
 
 		 1198 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  31.87 
 
 		 1204 aa  510  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 		 1185 aa  509  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  32.68 
 
 		 1198 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.93 
 
 		 1185 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  35.2 
 
 		 1187 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  29.57 
 
 		 1148 aa  483  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  30.24 
 
 		 1188 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  30.24 
 
 		 1188 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  33.31 
 
 		 1255 aa  473  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.85 
 
 		 1186 aa  464  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  28.45 
 
 		 1177 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  29.08 
 
 		 1189 aa  462  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.94 
 
 		 1185 aa  457  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  30.92 
 
 		 1174 aa  455  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  31.92 
 
 		 1168 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  31.16 
 
 		 1184 aa  447  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  33.83 
 
 		 1403 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  34.62 
 
 		 1192 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  30.02 
 
 		 1187 aa  445  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  31.74 
 
 		 1168 aa  445  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  30.41 
 
 		 1169 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  30.79 
 
 		 1169 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  30.98 
 
 		 1177 aa  435  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1164 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  32.82 
 
 		 1163 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  33.54 
 
 		 1201 aa  426  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  31.86 
 
 		 1174 aa  424  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  28.15 
 
 		 1191 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  30.51 
 
 		 1179 aa  423  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1164 aa  422  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  30.17 
 
 		 1179 aa  422  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  32.21 
 
 		 1171 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  33.28 
 
 		 1162 aa  423  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  33.2 
 
 		 1188 aa  423  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  33.76 
 
 		 1167 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  25.45 
 
 		 1180 aa  416  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  34.42 
 
 		 1162 aa  415  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  31.96 
 
 		 1162 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  32.44 
 
 		 1167 aa  413  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  31 
 
 		 1171 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  31.01 
 
 		 1171 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  32.03 
 
 		 1167 aa  405  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  32.41 
 
 		 1167 aa  405  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  30.23 
 
 		 1195 aa  406  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  31.93 
 
 		 1171 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  29.6 
 
 		 1164 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.67 
 
 		 1181 aa  395  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  33.28 
 
 		 1222 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  32.61 
 
 		 1165 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  28.28 
 
 		 1170 aa  387  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  30.92 
 
 		 1198 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  26.16 
 
 		 1164 aa  384  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  31.53 
 
 		 1175 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  33.04 
 
 		 1164 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  30.91 
 
 		 1173 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  30.97 
 
 		 1198 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  25.53 
 
 		 1175 aa  381  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  32.2 
 
 		 1206 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  29.4 
 
 		 1190 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  30.68 
 
 		 1268 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  31.92 
 
 		 1170 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  32.12 
 
 		 1170 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>