More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1975 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  42.69 
 
 
1189 aa  869    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  41.86 
 
 
1188 aa  848    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  56.14 
 
 
1189 aa  1274    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  37.48 
 
 
1179 aa  694    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  35.59 
 
 
1191 aa  709    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  56.23 
 
 
1189 aa  1274    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  56.14 
 
 
1189 aa  1271    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  56.43 
 
 
1189 aa  1283    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  56.06 
 
 
1189 aa  1271    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1187 aa  2358    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  55.98 
 
 
1189 aa  1296    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  37.68 
 
 
1196 aa  738    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  39.31 
 
 
1198 aa  732    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  56.23 
 
 
1189 aa  1274    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  37.18 
 
 
1186 aa  705    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  35.63 
 
 
1185 aa  669    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  38.86 
 
 
1187 aa  756    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  41.86 
 
 
1188 aa  848    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  35.88 
 
 
1185 aa  704    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  42.42 
 
 
1190 aa  804    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  39.6 
 
 
1190 aa  798    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  56.71 
 
 
1189 aa  1297    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  56.43 
 
 
1189 aa  1305    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  56.14 
 
 
1189 aa  1271    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  71.78 
 
 
1187 aa  1723    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  34.8 
 
 
1185 aa  681    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  34.5 
 
 
1185 aa  682    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  36.51 
 
 
1174 aa  677    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  35.76 
 
 
1184 aa  648    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  37.39 
 
 
1186 aa  690    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  37.98 
 
 
1185 aa  741    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  37.75 
 
 
1177 aa  701    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  56.14 
 
 
1189 aa  1274    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  36.41 
 
 
1190 aa  747    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  36.67 
 
 
1187 aa  627  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  34.06 
 
 
1177 aa  622  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  36.7 
 
 
1176 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  36.09 
 
 
1175 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  35.94 
 
 
1173 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  34.62 
 
 
1176 aa  588  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  35.28 
 
 
1176 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  35.28 
 
 
1177 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 
1176 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  34.95 
 
 
1199 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  34.73 
 
 
1199 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  34.81 
 
 
1199 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  32.58 
 
 
1191 aa  560  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  33.57 
 
 
1198 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  32.59 
 
 
1204 aa  534  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  33.36 
 
 
1255 aa  519  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  31.36 
 
 
1185 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  29.74 
 
 
1164 aa  493  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  31.39 
 
 
1186 aa  494  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  32.22 
 
 
1177 aa  490  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  32.2 
 
 
1179 aa  487  1e-136  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  29.87 
 
 
1148 aa  488  1e-136  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  28.75 
 
 
1178 aa  485  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  33.41 
 
 
1191 aa  473  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 
1178 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  31.1 
 
 
1181 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  31.15 
 
 
1174 aa  469  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  32.38 
 
 
1194 aa  461  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  29.23 
 
 
1176 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  28.2 
 
 
1180 aa  449  1.0000000000000001e-124  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  30.89 
 
 
1190 aa  446  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  31.28 
 
 
1142 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  33.03 
 
 
1162 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  32.75 
 
 
1191 aa  436  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  31.67 
 
 
1162 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  32.34 
 
 
1162 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  29.27 
 
 
1169 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  30.47 
 
 
1170 aa  432  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  30.24 
 
 
1170 aa  432  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  31.12 
 
 
1168 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  31.46 
 
 
1167 aa  423  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  30.92 
 
 
1167 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  30.63 
 
 
1141 aa  422  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  28.7 
 
 
1153 aa  422  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  30.79 
 
 
1167 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  31.11 
 
 
1167 aa  422  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.6 
 
 
1403 aa  418  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  32.09 
 
 
1198 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  31.41 
 
 
1175 aa  410  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  32.38 
 
 
1175 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  31.25 
 
 
1170 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  26.38 
 
 
1174 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 
1184 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  27.75 
 
 
1189 aa  376  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  28.02 
 
 
1171 aa  375  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  26.54 
 
 
1174 aa  361  6e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  26.9 
 
 
1189 aa  360  9e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  29.34 
 
 
1134 aa  358  3.9999999999999996e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  26.24 
 
 
1189 aa  353  7e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  27.25 
 
 
1193 aa  348  5e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  25.61 
 
 
1189 aa  338  5e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  30.8 
 
 
1172 aa  327  7e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  28.03 
 
 
1188 aa  324  6e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  33.03 
 
 
1185 aa  323  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  26.89 
 
 
1172 aa  322  3.9999999999999996e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  27.3 
 
 
1146 aa  320  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>