More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1270 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  58.72 
 
 		 1174 aa  1264    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  38.08 
 
 		 1162 aa  657    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  75.88 
 
 		 1206 aa  1699    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  39.97 
 
 		 1168 aa  712    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  76.56 
 
 		 1170 aa  1735    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  75.11 
 
 		 1172 aa  1707    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  37.83 
 
 		 1164 aa  647    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  37.21 
 
 		 1162 aa  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  37.56 
 
 		 1167 aa  655    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  36.67 
 
 		 1169 aa  676    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  75.71 
 
 		 1170 aa  1708    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  36.32 
 
 		 1164 aa  650    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  36.32 
 
 		 1164 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  37.81 
 
 		 1162 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  47.54 
 
 		 1234 aa  954    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  50.84 
 
 		 1167 aa  1052    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  75.71 
 
 		 1202 aa  1709    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  58.06 
 
 		 1175 aa  1249    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  85.4 
 
 		 1171 aa  1979    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  58.64 
 
 		 1174 aa  1251    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  49.92 
 
 		 1165 aa  1013    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1171 aa  2343    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  59.88 
 
 		 1175 aa  1321    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  75.71 
 
 		 1268 aa  1722    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  38.42 
 
 		 1170 aa  678    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  39.2 
 
 		 1162 aa  715    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  76.3 
 
 		 1170 aa  1727    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  36.41 
 
 		 1169 aa  677    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  37.91 
 
 		 1162 aa  672    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  59.92 
 
 		 1181 aa  1292    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  75.71 
 
 		 1200 aa  1709    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  47.18 
 
 		 1190 aa  989    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  38.55 
 
 		 1162 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  37.79 
 
 		 1167 aa  655    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  75.71 
 
 		 1170 aa  1716    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  38.23 
 
 		 1167 aa  662    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  60.2 
 
 		 1170 aa  1303    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  38.94 
 
 		 1163 aa  700    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  59.81 
 
 		 1171 aa  1320    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  37.82 
 
 		 1168 aa  694    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  44.91 
 
 		 1168 aa  868    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  58.06 
 
 		 1182 aa  1299    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  75.71 
 
 		 1198 aa  1749    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  75.53 
 
 		 1198 aa  1726    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  40.5 
 
 		 1164 aa  696    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  82.15 
 
 		 1171 aa  1949    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  40.78 
 
 		 1162 aa  701    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  54.42 
 
 		 1173 aa  1182    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  76.13 
 
 		 1170 aa  1729    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  75.88 
 
 		 1170 aa  1712    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  57.4 
 
 		 1175 aa  1240    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  36.89 
 
 		 1164 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  39.32 
 
 		 1162 aa  704    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  75.88 
 
 		 1170 aa  1713    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  38.18 
 
 		 1142 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  38.65 
 
 		 1142 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  98.04 
 
 		 1171 aa  2304    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  75.72 
 
 		 1142 aa  1665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  40.33 
 
 		 1162 aa  709    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  53.55 
 
 		 1152 aa  1117    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  38.06 
 
 		 1167 aa  702    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  76.22 
 
 		 1170 aa  1732    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  38.18 
 
 		 1142 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  58.48 
 
 		 1171 aa  1262    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  75.96 
 
 		 1170 aa  1719    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  56.98 
 
 		 1204 aa  1229    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  75.88 
 
 		 1170 aa  1713    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  37.45 
 
 		 1145 aa  632  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  35.12 
 
 		 1195 aa  629  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  37.14 
 
 		 1138 aa  612  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  36.78 
 
 		 1138 aa  612  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  37 
 
 		 1138 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  36.31 
 
 		 1133 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  34.97 
 
 		 1138 aa  594  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.61 
 
 		 1177 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.03 
 
 		 1176 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.19 
 
 		 1176 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.27 
 
 		 1175 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  31.7 
 
 		 1176 aa  459  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32 
 
 		 1173 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 		 1187 aa  420  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.56 
 
 		 1204 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.62 
 
 		 1148 aa  392  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  37.68 
 
 		 1162 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  37.76 
 
 		 1162 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.22 
 
 		 1190 aa  387  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.81 
 
 		 1178 aa  382  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 		 1198 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.33 
 
 		 1185 aa  379  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  27.94 
 
 		 1189 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  39.72 
 
 		 1168 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  30.61 
 
 		 1154 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  27.18 
 
 		 1176 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.3 
 
 		 1186 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.42 
 
 		 1403 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 		 1190 aa  355  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.8 
 
 		 1177 aa  354  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.03 
 
 		 1184 aa  354  5e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.24 
 
 		 1179 aa  354  5.9999999999999994e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  36.54 
 
 		 1165 aa  351  4e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>