More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1401 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  38.59 
 
 
1162 aa  695    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  44.32 
 
 
1172 aa  887    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  44.06 
 
 
1202 aa  873    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  36.52 
 
 
1162 aa  662    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  38.14 
 
 
1162 aa  677    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  44.06 
 
 
1170 aa  873    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  35.76 
 
 
1162 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  43.56 
 
 
1170 aa  865    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  45.01 
 
 
1167 aa  864    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  44.06 
 
 
1170 aa  875    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  43.87 
 
 
1175 aa  830    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  44.18 
 
 
1171 aa  907    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  45.33 
 
 
1165 aa  861    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  37.37 
 
 
1167 aa  643    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  43.06 
 
 
1175 aa  838    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  43.98 
 
 
1268 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  36.39 
 
 
1162 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  43.73 
 
 
1170 aa  870    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  43.54 
 
 
1175 aa  824    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  44.15 
 
 
1170 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  36.57 
 
 
1163 aa  648    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  44.12 
 
 
1190 aa  830    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  44.09 
 
 
1170 aa  870    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  44.35 
 
 
1206 aa  867    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  43.21 
 
 
1204 aa  824    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  41.27 
 
 
1171 aa  780    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  35.81 
 
 
1168 aa  671    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  43.82 
 
 
1170 aa  869    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  100 
 
 
1168 aa  2334    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  42.85 
 
 
1182 aa  828    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  43.73 
 
 
1198 aa  882    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  42.49 
 
 
1174 aa  820    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  38.37 
 
 
1164 aa  669    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  42.99 
 
 
1198 aa  867    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  44.14 
 
 
1170 aa  842    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  43.41 
 
 
1171 aa  897    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  44.06 
 
 
1200 aa  874    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  43.64 
 
 
1170 aa  868    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  44 
 
 
1173 aa  841    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  42.55 
 
 
1181 aa  808    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  44.12 
 
 
1171 aa  897    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  37.61 
 
 
1164 aa  650    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  43.89 
 
 
1234 aa  804    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  44.91 
 
 
1171 aa  910    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  43.3 
 
 
1152 aa  783    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  43.23 
 
 
1142 aa  825    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  38.6 
 
 
1162 aa  694    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  42.65 
 
 
1174 aa  811    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  43.2 
 
 
1171 aa  825    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  37.63 
 
 
1168 aa  667    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  43.64 
 
 
1170 aa  869    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  44.15 
 
 
1170 aa  875    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  37.49 
 
 
1162 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  36.55 
 
 
1169 aa  635  1e-180  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  36.47 
 
 
1169 aa  635  1e-180  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  34.98 
 
 
1164 aa  632  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  35.01 
 
 
1164 aa  631  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  37.44 
 
 
1170 aa  625  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  36.77 
 
 
1167 aa  621  1e-176  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  36.77 
 
 
1167 aa  622  1e-176  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  37.65 
 
 
1168 aa  615  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  36.1 
 
 
1167 aa  611  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  37.16 
 
 
1165 aa  601  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  36.83 
 
 
1142 aa  601  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  36.13 
 
 
1141 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  35.99 
 
 
1142 aa  594  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  35.85 
 
 
1139 aa  588  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  34.1 
 
 
1195 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  35.24 
 
 
1150 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  35.24 
 
 
1150 aa  509  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.32 
 
 
1177 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  30.26 
 
 
1175 aa  426  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.92 
 
 
1199 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  30.11 
 
 
1176 aa  416  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  32.42 
 
 
1199 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  32.11 
 
 
1199 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.64 
 
 
1190 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  29.75 
 
 
1154 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.24 
 
 
1190 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.42 
 
 
1187 aa  386  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.49 
 
 
1179 aa  383  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.26 
 
 
1191 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.29 
 
 
1189 aa  383  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  27.41 
 
 
1189 aa  382  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  27.33 
 
 
1189 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  27.41 
 
 
1189 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.78 
 
 
1185 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  27.41 
 
 
1189 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  27.33 
 
 
1189 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  28.13 
 
 
1189 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28.21 
 
 
1189 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  27.33 
 
 
1189 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  27.41 
 
 
1189 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  29.42 
 
 
1154 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  28.27 
 
 
1186 aa  373  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  28.77 
 
 
1154 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.09 
 
 
1189 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.53 
 
 
1187 aa  364  6e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  26.82 
 
 
1196 aa  363  9e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  28.15 
 
 
1174 aa  360  9.999999999999999e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>