More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1506 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  74.78 
 
 
1138 aa  1613    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  42.48 
 
 
1162 aa  764    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  39.7 
 
 
1169 aa  724    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  39.79 
 
 
1167 aa  713    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  89.78 
 
 
1145 aa  1942    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  41.29 
 
 
1162 aa  763    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  38.14 
 
 
1198 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  76.31 
 
 
1145 aa  1695    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  39.49 
 
 
1167 aa  676    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  38.85 
 
 
1164 aa  709    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  39.06 
 
 
1164 aa  707    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  51.22 
 
 
1139 aa  1034    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  41.07 
 
 
1162 aa  749    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  38.44 
 
 
1171 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  40.38 
 
 
1165 aa  685    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  37.68 
 
 
1165 aa  656    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  42.29 
 
 
1162 aa  766    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  41.03 
 
 
1170 aa  725    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  43.71 
 
 
1162 aa  783    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  53.49 
 
 
1140 aa  1048    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  37.73 
 
 
1175 aa  644    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  74.69 
 
 
1138 aa  1614    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  39.44 
 
 
1167 aa  675    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  74.61 
 
 
1138 aa  1605    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  42.49 
 
 
1162 aa  758    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  53.85 
 
 
1141 aa  1058    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  40.03 
 
 
1169 aa  731    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  74.34 
 
 
1138 aa  1602    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  41.26 
 
 
1162 aa  761    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  39.7 
 
 
1168 aa  737    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  38.28 
 
 
1198 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  52.39 
 
 
1138 aa  1027    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  38.1 
 
 
1175 aa  643    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  41.74 
 
 
1164 aa  765    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  40.2 
 
 
1168 aa  731    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  37.25 
 
 
1171 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  55.14 
 
 
1133 aa  1119    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  43.32 
 
 
1164 aa  817    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  41.94 
 
 
1162 aa  755    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  42.48 
 
 
1162 aa  766    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  38.42 
 
 
1164 aa  687    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1142 aa  2284    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  98.25 
 
 
1142 aa  2245    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  55 
 
 
1144 aa  1069    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  48.8 
 
 
814 aa  656    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  41.68 
 
 
1162 aa  763    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  39.57 
 
 
1167 aa  677    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  37.58 
 
 
1171 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  97.46 
 
 
1142 aa  2132    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  41.68 
 
 
1162 aa  758    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  38.2 
 
 
1170 aa  635  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  37.99 
 
 
1170 aa  635  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  38.49 
 
 
1170 aa  632  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  37.73 
 
 
1174 aa  630  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  37.86 
 
 
1174 aa  630  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  38.07 
 
 
1170 aa  632  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  37.93 
 
 
1175 aa  631  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  37.82 
 
 
1172 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  38.07 
 
 
1170 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  36.95 
 
 
1171 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  38.4 
 
 
1206 aa  625  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  37.84 
 
 
1181 aa  622  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  37.15 
 
 
1171 aa  620  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  37.34 
 
 
1170 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  37.26 
 
 
1182 aa  614  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  37.34 
 
 
1170 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  37.78 
 
 
1170 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  37.34 
 
 
1170 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  37.25 
 
 
1170 aa  612  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  37.12 
 
 
1268 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  38.02 
 
 
1170 aa  611  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  37.17 
 
 
1200 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  37.26 
 
 
1171 aa  611  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  37.17 
 
 
1202 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  37.97 
 
 
1142 aa  598  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  36.92 
 
 
1190 aa  594  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  34.4 
 
 
1152 aa  544  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  35.15 
 
 
1167 aa  513  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.76 
 
 
1175 aa  500  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  33.2 
 
 
1176 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  32.5 
 
 
1176 aa  479  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  77.13 
 
 
299 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.79 
 
 
1187 aa  453  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.41 
 
 
1189 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.09 
 
 
1189 aa  428  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  39.57 
 
 
1163 aa  425  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.94 
 
 
1190 aa  413  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  30.41 
 
 
1189 aa  409  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.17 
 
 
1190 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 
1188 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 
1188 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  30.66 
 
 
1184 aa  401  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  56.71 
 
 
1195 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  39.35 
 
 
1168 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 
1189 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  29.93 
 
 
1154 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  29.87 
 
 
1154 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  29.64 
 
 
1186 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  30.03 
 
 
1154 aa  386  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  30.54 
 
 
1153 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>