More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1334 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  75.53 
 
 		 1170 aa  1703    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  37.41 
 
 		 1164 aa  652    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  37.06 
 
 		 1167 aa  660    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  37.07 
 
 		 1162 aa  673    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  37.15 
 
 		 1162 aa  691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  53.55 
 
 		 1152 aa  1118    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  75.53 
 
 		 1170 aa  1707    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  58.81 
 
 		 1174 aa  1255    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  75.36 
 
 		 1170 aa  1701    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  36.48 
 
 		 1164 aa  655    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  36.48 
 
 		 1164 aa  654    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  37.49 
 
 		 1162 aa  695    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  47.67 
 
 		 1234 aa  957    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  51.07 
 
 		 1167 aa  1056    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  85.06 
 
 		 1171 aa  1973    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  75.53 
 
 		 1170 aa  1703    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  49.41 
 
 		 1165 aa  1005    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  74.94 
 
 		 1172 aa  1705    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  58.89 
 
 		 1174 aa  1268    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  75.36 
 
 		 1268 aa  1712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  38.65 
 
 		 1170 aa  671    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  39.19 
 
 		 1162 aa  713    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  37.28 
 
 		 1167 aa  660    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  75.79 
 
 		 1170 aa  1712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  37.95 
 
 		 1162 aa  656    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  60.12 
 
 		 1181 aa  1300    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  75.36 
 
 		 1202 aa  1699    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  60.12 
 
 		 1170 aa  1303    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  38.94 
 
 		 1163 aa  705    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  58.49 
 
 		 1175 aa  1254    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  47.22 
 
 		 1190 aa  986    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  54.43 
 
 		 1173 aa  1184    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  75.36 
 
 		 1170 aa  1707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  59.97 
 
 		 1175 aa  1328    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  57.41 
 
 		 1204 aa  1234    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1171 aa  2342    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  59.73 
 
 		 1171 aa  1320    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  37.06 
 
 		 1168 aa  692    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  44.57 
 
 		 1168 aa  863    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  58.57 
 
 		 1182 aa  1309    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  75.28 
 
 		 1198 aa  1738    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  35.87 
 
 		 1169 aa  667    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  40.4 
 
 		 1164 aa  700    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  39.47 
 
 		 1162 aa  708    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  82.15 
 
 		 1171 aa  1948    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  75.62 
 
 		 1170 aa  1715    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  75.53 
 
 		 1170 aa  1703    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  75.36 
 
 		 1200 aa  1699    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  37.06 
 
 		 1164 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  75.71 
 
 		 1206 aa  1694    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  58.91 
 
 		 1171 aa  1274    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  76.05 
 
 		 1170 aa  1720    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  39.01 
 
 		 1162 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  37.41 
 
 		 1142 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  37.95 
 
 		 1142 aa  646    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  39.97 
 
 		 1168 aa  705    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  98.04 
 
 		 1171 aa  2304    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  75.2 
 
 		 1142 aa  1651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  39.8 
 
 		 1162 aa  708    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  36.06 
 
 		 1169 aa  667    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  75.11 
 
 		 1198 aa  1716    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  75.71 
 
 		 1170 aa  1718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  57.28 
 
 		 1175 aa  1239    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  37.79 
 
 		 1142 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  37.72 
 
 		 1167 aa  661    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  40.78 
 
 		 1162 aa  701    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  38.3 
 
 		 1167 aa  700    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  35.16 
 
 		 1195 aa  631  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  36.73 
 
 		 1145 aa  625  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  36.38 
 
 		 1138 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  36.52 
 
 		 1138 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  36.52 
 
 		 1138 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  35.39 
 
 		 1133 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  35.25 
 
 		 1138 aa  596  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.27 
 
 		 1176 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.81 
 
 		 1177 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  30.97 
 
 		 1176 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.79 
 
 		 1175 aa  465  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  31.73 
 
 		 1176 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.54 
 
 		 1173 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  31.45 
 
 		 1199 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.43 
 
 		 1187 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  32.02 
 
 		 1199 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  32.02 
 
 		 1199 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.93 
 
 		 1176 aa  415  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.22 
 
 		 1204 aa  412  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.92 
 
 		 1148 aa  395  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  37.68 
 
 		 1162 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  37.61 
 
 		 1162 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.94 
 
 		 1190 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  29.6 
 
 		 1198 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.27 
 
 		 1185 aa  379  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.43 
 
 		 1187 aa  379  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.58 
 
 		 1178 aa  376  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  41.19 
 
 		 1168 aa  375  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.06 
 
 		 1403 aa  373  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  27.38 
 
 		 1176 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.01 
 
 		 1186 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.06 
 
 		 1177 aa  362  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.33 
 
 		 1184 aa  360  6e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>