More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4719 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  42.58 
 
 
1178 aa  957    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1176 aa  2382    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  32.51 
 
 
1177 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  32.86 
 
 
1185 aa  568  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  31.2 
 
 
1185 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  31.46 
 
 
1186 aa  557  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  32.47 
 
 
1179 aa  558  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  32.05 
 
 
1178 aa  553  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  30.72 
 
 
1176 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.89 
 
 
1176 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  31.94 
 
 
1176 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  31.51 
 
 
1176 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.14 
 
 
1177 aa  493  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  30.28 
 
 
1199 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  30.43 
 
 
1199 aa  486  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  30.27 
 
 
1199 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  29.88 
 
 
1173 aa  482  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  29.34 
 
 
1175 aa  478  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  28.97 
 
 
1198 aa  466  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.81 
 
 
1187 aa  465  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29.28 
 
 
1189 aa  466  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  30.53 
 
 
1198 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  28.68 
 
 
1189 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  29.41 
 
 
1189 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  29.13 
 
 
1196 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.6 
 
 
1189 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.21 
 
 
1189 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  29.01 
 
 
1189 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  29.01 
 
 
1189 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  29.09 
 
 
1189 aa  452  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  28.93 
 
 
1189 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  28.49 
 
 
1191 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  29.52 
 
 
1189 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  29.52 
 
 
1189 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  29.11 
 
 
1187 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.35 
 
 
1187 aa  442  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 
1185 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.27 
 
 
1148 aa  428  1e-118  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.08 
 
 
1167 aa  423  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  27.99 
 
 
1204 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.39 
 
 
1190 aa  419  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  28.19 
 
 
1186 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  27.41 
 
 
1185 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  27.88 
 
 
1185 aa  409  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  28.52 
 
 
1167 aa  402  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  27.35 
 
 
1177 aa  398  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.54 
 
 
1186 aa  397  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 
1162 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.56 
 
 
1188 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.56 
 
 
1188 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.56 
 
 
1184 aa  396  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  28.43 
 
 
1168 aa  392  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  28.7 
 
 
1164 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  27.4 
 
 
1167 aa  389  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  27.4 
 
 
1167 aa  389  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.64 
 
 
1179 aa  389  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  28.51 
 
 
1162 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  28.01 
 
 
1171 aa  379  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  28.61 
 
 
1162 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  28.26 
 
 
1162 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  27.28 
 
 
1171 aa  376  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  27.03 
 
 
1172 aa  373  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  26.85 
 
 
1164 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.39 
 
 
1177 aa  371  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.12 
 
 
1179 aa  367  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  27.38 
 
 
1164 aa  365  2e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  26.56 
 
 
1195 aa  365  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.01 
 
 
1174 aa  365  3e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  28.04 
 
 
1403 aa  364  7.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  27.28 
 
 
1164 aa  361  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  27.13 
 
 
1172 aa  357  5e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  27.04 
 
 
1175 aa  357  8.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  27.86 
 
 
1164 aa  356  1e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  27.66 
 
 
1170 aa  353  8e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  28.04 
 
 
1308 aa  352  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  27.56 
 
 
1180 aa  345  2e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  26.44 
 
 
1201 aa  345  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  26.28 
 
 
1182 aa  340  7e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  27.95 
 
 
1268 aa  340  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.58 
 
 
1170 aa  336  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  26.01 
 
 
1194 aa  336  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  26.38 
 
 
1153 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  24.5 
 
 
1174 aa  293  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  24.47 
 
 
1181 aa  289  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  24.61 
 
 
1134 aa  273  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.89 
 
 
1190 aa  262  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  43.73 
 
 
1190 aa  249  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  25.04 
 
 
1189 aa  247  9e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  25.93 
 
 
1189 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  22.41 
 
 
1171 aa  244  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  25.77 
 
 
1301 aa  241  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  38.97 
 
 
1176 aa  233  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  24.27 
 
 
1189 aa  230  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  24.6 
 
 
1082 aa  230  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  26.19 
 
 
1191 aa  228  6e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  46.93 
 
 
1185 aa  225  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  37.58 
 
 
1190 aa  225  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  46.93 
 
 
1185 aa  225  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  22.8 
 
 
1174 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  24.8 
 
 
1192 aa  222  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>