More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1669 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  77.17 
 
 
1171 aa  1742    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  37.99 
 
 
1162 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  57.82 
 
 
1198 aa  1236    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  51.5 
 
 
1152 aa  1011    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  57.84 
 
 
1170 aa  1218    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  37.76 
 
 
1162 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  47.94 
 
 
1167 aa  938    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  59.15 
 
 
1171 aa  1280    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  59.56 
 
 
1171 aa  1301    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  47.36 
 
 
1165 aa  905    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  77.37 
 
 
1181 aa  1745    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  57.75 
 
 
1268 aa  1223    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  38.03 
 
 
1162 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  58.5 
 
 
1170 aa  1236    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  78.96 
 
 
1175 aa  1773    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  38.24 
 
 
1163 aa  662    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  57.84 
 
 
1170 aa  1219    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  99.57 
 
 
1174 aa  2328    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  43.52 
 
 
1190 aa  847    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  51.61 
 
 
1173 aa  1067    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  58.25 
 
 
1172 aa  1229    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  58.18 
 
 
1170 aa  1228    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  58.98 
 
 
1171 aa  1286    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  57.75 
 
 
1170 aa  1217    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  38.99 
 
 
1162 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  58.76 
 
 
1206 aa  1221    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  58.69 
 
 
1170 aa  1239    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  77.75 
 
 
1171 aa  1811    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  37.32 
 
 
1168 aa  671    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  43.18 
 
 
1168 aa  793    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  77.52 
 
 
1182 aa  1801    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  57.91 
 
 
1198 aa  1247    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  45.93 
 
 
1234 aa  889    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  37.67 
 
 
1164 aa  652    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  58.59 
 
 
1170 aa  1233    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  59.1 
 
 
1171 aa  1310    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  71.31 
 
 
1175 aa  1625    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1174 aa  2335    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  39.28 
 
 
1168 aa  657    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  58.43 
 
 
1170 aa  1235    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  87.91 
 
 
1175 aa  2005    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  39.23 
 
 
1162 aa  651    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  82.69 
 
 
1204 aa  1873    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  57.75 
 
 
1200 aa  1216    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  37.85 
 
 
1142 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  38.25 
 
 
1162 aa  655    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  57.93 
 
 
1142 aa  1181    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  38.65 
 
 
1162 aa  655    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  67.89 
 
 
1170 aa  1504    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  57.84 
 
 
1170 aa  1219    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  58.52 
 
 
1170 aa  1238    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  38.75 
 
 
1142 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  57.75 
 
 
1202 aa  1216    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  37.53 
 
 
1142 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  38.39 
 
 
1162 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  38.7 
 
 
1170 aa  630  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  36.9 
 
 
1140 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  35.25 
 
 
1169 aa  621  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  37.59 
 
 
1167 aa  621  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  35.35 
 
 
1169 aa  621  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  37.43 
 
 
1145 aa  619  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  37.07 
 
 
1145 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  36.16 
 
 
1167 aa  614  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  35.59 
 
 
1195 aa  615  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  36.52 
 
 
1138 aa  612  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  37.35 
 
 
1141 aa  609  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  36.69 
 
 
1138 aa  612  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  35.93 
 
 
1167 aa  612  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  37.73 
 
 
1167 aa  606  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  36.25 
 
 
1138 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  36.86 
 
 
1138 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  38.76 
 
 
1164 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  34.6 
 
 
1164 aa  583  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  34.31 
 
 
1164 aa  584  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  35.61 
 
 
1109 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  35.7 
 
 
1150 aa  488  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  35.7 
 
 
1150 aa  489  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.78 
 
 
1176 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  34.61 
 
 
1167 aa  469  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  31.21 
 
 
1176 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.49 
 
 
1176 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.7 
 
 
1187 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.39 
 
 
1177 aa  428  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.11 
 
 
1175 aa  426  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.96 
 
 
1173 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.13 
 
 
1176 aa  415  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  27.96 
 
 
1204 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.29 
 
 
1185 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.79 
 
 
1190 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28.41 
 
 
1189 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.31 
 
 
1187 aa  395  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  30.92 
 
 
1153 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  26.54 
 
 
1190 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 
1177 aa  369  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.14 
 
 
1178 aa  366  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  40.06 
 
 
1168 aa  363  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  36.65 
 
 
1162 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.79 
 
 
1403 aa  354  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  36.56 
 
 
1162 aa  353  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  28.95 
 
 
1184 aa  353  1e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>