More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1888 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 
1163 aa  706    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  75.53 
 
 
1170 aa  1717    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  60.03 
 
 
1170 aa  1294    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  85.4 
 
 
1171 aa  1979    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  76.9 
 
 
1170 aa  1753    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  37.77 
 
 
1162 aa  680    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  76.56 
 
 
1172 aa  1736    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  76.13 
 
 
1198 aa  1749    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  36.54 
 
 
1167 aa  652    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  75.36 
 
 
1170 aa  1713    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  37.19 
 
 
1162 aa  682    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  50.04 
 
 
1167 aa  1038    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  36.86 
 
 
1169 aa  674    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1171 aa  2348    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  57.47 
 
 
1175 aa  1258    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  49.12 
 
 
1165 aa  991    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  75.36 
 
 
1200 aa  1713    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  75.45 
 
 
1268 aa  1722    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  38.03 
 
 
1170 aa  664    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  38.98 
 
 
1162 aa  709    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  56.89 
 
 
1204 aa  1234    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  77.16 
 
 
1170 aa  1755    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  85.06 
 
 
1171 aa  1947    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  75.53 
 
 
1170 aa  1717    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  36.54 
 
 
1167 aa  652    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  59.04 
 
 
1175 aa  1276    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  60.25 
 
 
1181 aa  1310    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  46.59 
 
 
1190 aa  961    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  59.22 
 
 
1174 aa  1267    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  54.71 
 
 
1173 aa  1191    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  75.53 
 
 
1170 aa  1723    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  37.88 
 
 
1162 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  75.53 
 
 
1170 aa  1717    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  38.2 
 
 
1162 aa  692    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  59.73 
 
 
1171 aa  1315    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  38.71 
 
 
1168 aa  727    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  44 
 
 
1168 aa  867    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  58.91 
 
 
1182 aa  1318    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  76.39 
 
 
1198 aa  1763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  39.57 
 
 
1162 aa  698    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  36.96 
 
 
1167 aa  677    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  90.95 
 
 
1171 aa  2164    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  60.85 
 
 
1175 aa  1341    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  76.39 
 
 
1206 aa  1726    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  76.82 
 
 
1170 aa  1759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  59.2 
 
 
1171 aa  1285    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  59.39 
 
 
1174 aa  1280    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  36.86 
 
 
1169 aa  670    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  76.51 
 
 
1142 aa  1696    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  38.56 
 
 
1162 aa  694    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  37.42 
 
 
1167 aa  660    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  77.25 
 
 
1170 aa  1763    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  38.74 
 
 
1164 aa  655    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  53.78 
 
 
1152 aa  1119    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  76.9 
 
 
1170 aa  1760    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  47.74 
 
 
1234 aa  951    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  75.36 
 
 
1202 aa  1714    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  40.47 
 
 
1168 aa  715    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  35.4 
 
 
1164 aa  629  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  37.15 
 
 
1164 aa  626  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  39.3 
 
 
1168 aa  629  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  35.96 
 
 
1164 aa  625  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  36.66 
 
 
1145 aa  625  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  37.98 
 
 
1142 aa  625  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  37.38 
 
 
1142 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  36.59 
 
 
1145 aa  611  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  35 
 
 
1195 aa  612  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  35.82 
 
 
1138 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  36.24 
 
 
1138 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  35.17 
 
 
1138 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  34.3 
 
 
1150 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  34.3 
 
 
1150 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  34.31 
 
 
1167 aa  501  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.41 
 
 
1176 aa  479  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.68 
 
 
1176 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  31 
 
 
1176 aa  459  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.43 
 
 
1175 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  29.89 
 
 
1177 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.8 
 
 
1173 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.84 
 
 
1204 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  32.4 
 
 
1199 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  31.94 
 
 
1199 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.67 
 
 
1187 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  31.64 
 
 
1198 aa  426  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  32.32 
 
 
1199 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.65 
 
 
1191 aa  396  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  37.68 
 
 
1162 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.73 
 
 
1187 aa  389  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  28.36 
 
 
1189 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  38.01 
 
 
1162 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  38.25 
 
 
1162 aa  387  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.32 
 
 
1189 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  26.85 
 
 
1190 aa  386  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.92 
 
 
1185 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.22 
 
 
1403 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.35 
 
 
1178 aa  370  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  29.17 
 
 
1179 aa  367  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  27.63 
 
 
1176 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  27.76 
 
 
1184 aa  362  2e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  37.05 
 
 
1165 aa  358  3.9999999999999996e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>