More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0900 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1150 aa  2272    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  99.91 
 
 		 1150 aa  2270    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  35.88 
 
 		 1162 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  36.13 
 
 		 1168 aa  546  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  34.25 
 
 		 1168 aa  544  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  35.16 
 
 		 1162 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  35.51 
 
 		 1171 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  34.61 
 
 		 1162 aa  531  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  34.98 
 
 		 1162 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  34.54 
 
 		 1171 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  35.45 
 
 		 1162 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  35.54 
 
 		 1162 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  37.14 
 
 		 1164 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  32.92 
 
 		 1169 aa  518  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  37.06 
 
 		 1175 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  35.25 
 
 		 1171 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  34.53 
 
 		 1162 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  32.1 
 
 		 1169 aa  511  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  36.2 
 
 		 1175 aa  509  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  33.58 
 
 		 1133 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  33.12 
 
 		 1164 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  34.13 
 
 		 1167 aa  504  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  34.48 
 
 		 1162 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  35.49 
 
 		 1198 aa  505  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  34.05 
 
 		 1167 aa  504  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  35.74 
 
 		 1170 aa  504  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  34.3 
 
 		 1142 aa  505  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  34.68 
 
 		 1167 aa  502  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  34.27 
 
 		 1162 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  35.07 
 
 		 1198 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  33.69 
 
 		 1170 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  34.53 
 
 		 1142 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  34.78 
 
 		 1182 aa  496  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  36.1 
 
 		 1174 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  33.28 
 
 		 1145 aa  490  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  34.78 
 
 		 1206 aa  492  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  33.94 
 
 		 1170 aa  493  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  36.04 
 
 		 1174 aa  490  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  36.55 
 
 		 1167 aa  486  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  35.66 
 
 		 1170 aa  483  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  35.58 
 
 		 1170 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  36.18 
 
 		 1175 aa  482  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  35.5 
 
 		 1202 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  35.5 
 
 		 1200 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  35.69 
 
 		 1268 aa  482  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  35.61 
 
 		 1170 aa  482  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  35 
 
 		 1181 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  35.5 
 
 		 1170 aa  479  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  34.81 
 
 		 1171 aa  475  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  33.87 
 
 		 1142 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  33.93 
 
 		 1167 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  33.82 
 
 		 1190 aa  466  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.17 
 
 		 1173 aa  420  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  30.98 
 
 		 1176 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.38 
 
 		 1176 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  30.71 
 
 		 1199 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  30.72 
 
 		 1199 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  30.41 
 
 		 1199 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  30.7 
 
 		 1175 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.29 
 
 		 1190 aa  375  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.62 
 
 		 1185 aa  357  5.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  26.28 
 
 		 1204 aa  355  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  27.16 
 
 		 1187 aa  352  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  27.87 
 
 		 1185 aa  347  8e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  24.41 
 
 		 1190 aa  335  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  25.12 
 
 		 1172 aa  335  3e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  23.91 
 
 		 1177 aa  335  4e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  27.87 
 
 		 1178 aa  333  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 		 1176 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.29 
 
 		 1403 aa  330  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.4 
 
 		 1186 aa  320  1e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.34 
 
 		 1179 aa  319  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  25.36 
 
 		 1185 aa  318  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.25 
 
 		 1177 aa  313  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.22 
 
 		 1170 aa  312  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.74 
 
 		 1170 aa  306  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  32.11 
 
 		 1165 aa  305  5.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  31.98 
 
 		 1163 aa  294  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  34.59 
 
 		 1140 aa  293  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  33.16 
 
 		 1164 aa  280  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  34.43 
 
 		 1138 aa  280  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  34.43 
 
 		 1138 aa  280  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  36.06 
 
 		 1168 aa  280  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  32.69 
 
 		 1164 aa  279  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  55.42 
 
 		 1138 aa  279  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  52.55 
 
 		 1142 aa  278  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  54.36 
 
 		 1145 aa  278  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  46.67 
 
 		 1144 aa  277  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  46.53 
 
 		 1164 aa  275  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  53.53 
 
 		 1138 aa  274  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  53.53 
 
 		 1138 aa  274  9e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  32.91 
 
 		 1165 aa  273  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  55.75 
 
 		 1141 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.48 
 
 		 1174 aa  270  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  36.04 
 
 		 1168 aa  270  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  47.54 
 
 		 299 aa  269  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  53.16 
 
 		 1195 aa  270  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  53.74 
 
 		 1162 aa  269  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  32.14 
 
 		 1234 aa  269  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  53.74 
 
 		 1162 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>