More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1732 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  50.26 
 
 		 1170 aa  1029    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  38.99 
 
 		 1162 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  47.26 
 
 		 1171 aa  947    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  50.6 
 
 		 1172 aa  1048    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  50.86 
 
 		 1198 aa  1060    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  39.18 
 
 		 1162 aa  673    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  39.32 
 
 		 1167 aa  683    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  46.33 
 
 		 1173 aa  914    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  50.26 
 
 		 1170 aa  1030    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  38.37 
 
 		 1162 aa  668    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1167 aa  2320    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  50.04 
 
 		 1171 aa  1055    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  46.71 
 
 		 1175 aa  932    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  47.1 
 
 		 1165 aa  932    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  36.92 
 
 		 1169 aa  642    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  48.14 
 
 		 1174 aa  953    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  50.17 
 
 		 1268 aa  1028    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  39.53 
 
 		 1162 aa  689    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  50.34 
 
 		 1170 aa  1047    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  48.43 
 
 		 1181 aa  982    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  50.17 
 
 		 1200 aa  1027    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  46.89 
 
 		 1190 aa  944    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  38.94 
 
 		 1168 aa  657    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  36.74 
 
 		 1145 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  50.47 
 
 		 1170 aa  1021    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  47.48 
 
 		 1175 aa  927    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  46.88 
 
 		 1204 aa  929    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  47.18 
 
 		 1171 aa  947    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  39.59 
 
 		 1168 aa  714    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  45.13 
 
 		 1168 aa  839    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  47.4 
 
 		 1182 aa  972    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  50.77 
 
 		 1198 aa  1065    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  38.9 
 
 		 1164 aa  653    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  38.94 
 
 		 1167 aa  672    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  48.06 
 
 		 1174 aa  946    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  49.79 
 
 		 1171 aa  1064    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  39.72 
 
 		 1162 aa  697    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  50.09 
 
 		 1170 aa  1040    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  50.43 
 
 		 1170 aa  1043    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  50.17 
 
 		 1202 aa  1028    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  50.26 
 
 		 1170 aa  1030    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  50.84 
 
 		 1171 aa  1069    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  39.17 
 
 		 1167 aa  672    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  48.45 
 
 		 1175 aa  957    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  38.79 
 
 		 1167 aa  699    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  49.38 
 
 		 1142 aa  991    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  39.88 
 
 		 1162 aa  696    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  38.9 
 
 		 1162 aa  666    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  45.58 
 
 		 1152 aa  853    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  50.17 
 
 		 1206 aa  1026    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  50.6 
 
 		 1170 aa  1046    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  39.47 
 
 		 1162 aa  675    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  50.52 
 
 		 1170 aa  1046    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  40.17 
 
 		 1162 aa  689    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  39.42 
 
 		 1162 aa  675    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  50.99 
 
 		 1234 aa  1041    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  48.04 
 
 		 1170 aa  932    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  39.31 
 
 		 1162 aa  665    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  50.26 
 
 		 1170 aa  1030    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  51.07 
 
 		 1171 aa  1060    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  38.62 
 
 		 1164 aa  635  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  37.19 
 
 		 1142 aa  635  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  38.13 
 
 		 1145 aa  627  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  37.8 
 
 		 1142 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  35.77 
 
 		 1164 aa  620  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  35.93 
 
 		 1138 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  35.66 
 
 		 1164 aa  613  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  35.7 
 
 		 1164 aa  613  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  36.18 
 
 		 1140 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  36.15 
 
 		 1141 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  34.99 
 
 		 1167 aa  499  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  33.41 
 
 		 1150 aa  485  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  33.41 
 
 		 1150 aa  486  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.16 
 
 		 1176 aa  466  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  31.2 
 
 		 1176 aa  446  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.26 
 
 		 1173 aa  429  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.31 
 
 		 1187 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  31.06 
 
 		 1187 aa  406  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.71 
 
 		 1189 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.23 
 
 		 1189 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.1 
 
 		 1189 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  30.29 
 
 		 1189 aa  396  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  30.29 
 
 		 1189 aa  396  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.13 
 
 		 1189 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.19 
 
 		 1189 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  36.7 
 
 		 1163 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.38 
 
 		 1191 aa  379  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  28.09 
 
 		 1186 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  35.22 
 
 		 1142 aa  356  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  35.27 
 
 		 1169 aa  352  3e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  37.57 
 
 		 1195 aa  344  5e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  39.07 
 
 		 1165 aa  342  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  35.56 
 
 		 1138 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  35.2 
 
 		 1138 aa  341  5.9999999999999996e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  56.65 
 
 		 1168 aa  341  5.9999999999999996e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  35.56 
 
 		 1138 aa  340  8e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  37.72 
 
 		 1144 aa  337  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  34.62 
 
 		 1138 aa  334  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  28.13 
 
 		 1170 aa  333  1e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  52.12 
 
 		 1170 aa  324  6e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>