More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1524 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  41.89 
 
 
1165 aa  816    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  44.48 
 
 
1163 aa  889    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  44.66 
 
 
1162 aa  892    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  38.02 
 
 
1141 aa  680    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  39.52 
 
 
1109 aa  728    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  37.66 
 
 
1195 aa  731    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  38.56 
 
 
1145 aa  696    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  45.07 
 
 
1162 aa  934    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  39.07 
 
 
1138 aa  712    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  45.46 
 
 
1162 aa  935    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  36.3 
 
 
1170 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  36.96 
 
 
1164 aa  735    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  37.07 
 
 
1164 aa  736    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  44.56 
 
 
1162 aa  922    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  44.2 
 
 
1162 aa  882    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  36.81 
 
 
1167 aa  636    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  38.46 
 
 
1145 aa  712    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  44.36 
 
 
1162 aa  908    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  36.95 
 
 
1171 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  38.56 
 
 
1165 aa  683    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  40.02 
 
 
1167 aa  829    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  36.36 
 
 
1268 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  42.92 
 
 
1170 aa  867    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  44.91 
 
 
1162 aa  915    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  39.95 
 
 
1164 aa  776    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  36.74 
 
 
1170 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  40.79 
 
 
1167 aa  827    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  38.97 
 
 
1138 aa  704    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  41.01 
 
 
1167 aa  847    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  36.3 
 
 
1170 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  36.94 
 
 
1170 aa  657    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  36.98 
 
 
1206 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  37.62 
 
 
1170 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  36.87 
 
 
1198 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  100 
 
 
1169 aa  2380    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  44.58 
 
 
1162 aa  892    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  44.33 
 
 
1168 aa  954    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  36.79 
 
 
1170 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  36.12 
 
 
1198 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  36.69 
 
 
1138 aa  651    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  38.53 
 
 
1138 aa  705    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  36.17 
 
 
1173 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  40.02 
 
 
1164 aa  758    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  36.28 
 
 
1202 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  37.12 
 
 
1171 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  37.72 
 
 
1133 aa  684    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  40.79 
 
 
1167 aa  825    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  36.95 
 
 
1170 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  45.42 
 
 
1162 aa  956    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  36.28 
 
 
1200 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  38.24 
 
 
1164 aa  741    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  45.25 
 
 
1162 aa  947    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  36.03 
 
 
1171 aa  660    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  36.39 
 
 
1170 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  39.03 
 
 
1142 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  39.22 
 
 
1142 aa  722    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  43.32 
 
 
1168 aa  847    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  37.52 
 
 
1140 aa  682    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  45.64 
 
 
1162 aa  956    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  45.36 
 
 
1168 aa  955    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  36.67 
 
 
1171 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  36.95 
 
 
1170 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  99.23 
 
 
1169 aa  2359    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  39.03 
 
 
1142 aa  714    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  36.3 
 
 
1170 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  36.08 
 
 
1172 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  34.19 
 
 
1175 aa  630  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  36.71 
 
 
1190 aa  630  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  35.1 
 
 
1170 aa  623  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  35.85 
 
 
1181 aa  622  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  36.06 
 
 
1142 aa  621  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  34.84 
 
 
1175 aa  619  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 
1174 aa  618  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  35.83 
 
 
1175 aa  617  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 
1182 aa  617  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  35.42 
 
 
1171 aa  613  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  34.72 
 
 
1174 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 
1234 aa  614  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  35 
 
 
1171 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  35.15 
 
 
1204 aa  595  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  33.65 
 
 
1167 aa  514  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  33.14 
 
 
1150 aa  509  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  33.14 
 
 
1150 aa  509  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.89 
 
 
1176 aa  505  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  30.65 
 
 
1177 aa  503  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.44 
 
 
1173 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.8 
 
 
1199 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  31.61 
 
 
1199 aa  489  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.88 
 
 
1199 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  30.59 
 
 
1175 aa  479  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  30.33 
 
 
1176 aa  479  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.39 
 
 
1176 aa  465  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  30.87 
 
 
1198 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.34 
 
 
1187 aa  440  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28.42 
 
 
1189 aa  438  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  28.92 
 
 
1187 aa  435  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.81 
 
 
1185 aa  432  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  27.51 
 
 
1188 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  27.51 
 
 
1188 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.3 
 
 
1189 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>